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Enregistrement W2652345243 · doi:10.1200/po.16.00031

Homologous Recombination Deficiency in Breast Cancer: A Clinical Review

2017· review· en· W2652345243 sur OpenAlexaff
Wendie Den Brok, Kasmintan A. Schrader, Sophie Sun, Anna V. Tinker, Eric Y. Stutheit-Zhao, Samuel Aparício, Karen A. Gelmon

Notice bibliographique

RevueJCO Precision Oncology · 2017
Typereview
Langueen
DomaineMedicine
ThématiquePARP inhibition in cancer therapy
Établissements canadiensBC Cancer Agency
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésHomologous recombinationBreast cancerHomologous chromosomeBRCA2 ProteinMedicineDNA repairGermline mutationGermlineCancerClinical significanceBioinformaticsMutationGeneticsBiologyInternal medicineDNAGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BRCA1 and BRCA2 germline mutation–associated breast cancers are known to be deficient in the process of homologous recombination and often respond favorably to drugs targeting this important DNA repair pathway. There is emerging evidence that a significant proportion of patients with BRCA1/ BRCA2 wild-type breast cancer are also deficient in homologous recombination, and it is hypothesized that these patients may derive similar benefit from drugs targeting this pathway. Current research has focused on the development of a companion diagnostic to identify these sporadic BRCA-like tumors. This review outlines the various approaches that researchers have taken to predict homologous recombination deficiency as part of correlative biomarker work in various studies and clinical trials in breast cancer. As some of these tests of homologous recombination deficiency move closer to clinical use, understanding the approach and limitations of each is of relevance to clinicians who treat patients with breast cancer.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,014

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0030,003
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,002

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,306
Tête enseignante GPT0,592
Écart entre enseignants0,286 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations89
Publié2017
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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