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Enregistrement W2677331635 · doi:10.2217/pgs-2017-0035

Rationale and Design of the Multiethnic Pharmacogenomics in Childhood Asthma Consortium

2017· article· en· W2677331635 sur OpenAlexaff
Niloufar Farzan, Susanne J. H. Vijverberg, Anand Kumar Andiappan, Lambang Arianto, Vojko Berce, Natalia Blanca‐López, Hans Bisgaard, Klaus B⊘nnelykke, Esteban G. Burchard, Paloma Campo, Glorisa Canino, Bruce Carleton, Juan C Celedón, Fook Tim Chew, Wen Chin Chiang, Michelle M. Cloutier, Denis Daley, Herman T. den Dekker, F. Nicole Dijk, Liesbeth Duijts, Carlos Flores, Erick Forno, Daniel B. Hawcutt, Natalia Hernandez‐Pacheco, Johan C. de Jongste, Michael Kabesch, Gerard H. Koppelman, Vangelis G. Manolopoulos, Erik Melén, Somnath Mukhopadhyay, Sara Nilsson, Maria Pino‐Yanes, Munir Pirmohamed, Uros Potočnki, Jan A. M. Raaijmakers, Katja Repnik, Maximilian Schieck, Yang Yie Sio, Rosalind L. Smyth, Csaba Szalai, Kelan G. Tantisira, Steve Turner, Marc P. van der Schee, Katia Verhamme, Anke H. Maitland‐van der Zee

Notice bibliographique

RevuePharmacogenomics · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAsthma and respiratory diseases
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesMedical Research CouncilStockholms Läns LandstingStichting Astma BestrijdingHjärt-LungfondenNational Institutes of HealthNational Heart, Lung, and Blood InstituteVetenskapsrådetKarolinska InstitutetLundbeckfondenEuropean CommissionInstituto de Salud Carlos IIINational Institute for Health and Care Research
Mots-clésPharmacogenomicsAsthmaMedicinePharmacogeneticsPharmacologyInternal medicineGeneticsBiologyGenotype

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

AIM: International collaboration is needed to enable large-scale pharmacogenomics studies in childhood asthma. Here, we describe the design of the Pharmacogenomics in Childhood Asthma (PiCA) consortium. MATERIALS & METHODS: Investigators of each study participating in PiCA provided data on the study characteristics by answering an online questionnaire. RESULTS: A total of 21 studies, including 14,227 children/young persons (58% male), from 12 different countries are currently enrolled in the PiCA consortium. Fifty six percent of the patients are Caucasians. In total, 7619 were inhaled corticosteroid users. Among patients from 13 studies with available data on asthma exacerbations, a third reported exacerbations despite inhaled corticosteroid use. In the future pharmacogenomics studies within the consortium, the pharmacogenomics analyses will be performed separately in each center and the results will be meta-analyzed. CONCLUSION: PiCA is a valuable platform to perform pharmacogenetics studies within a multiethnic pediatric asthma population.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,152
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,109
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Protocole · Signal consensuel: Protocole
Score de désaccord entre enseignants0,152
Score d'incertitude au seuil0,803

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,1520,109
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,002
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,002
Bibliométrie0,0040,006
Études des sciences et des technologies0,0060,004
Communication savante0,0050,003
Science ouverte0,0060,009
Intégrité de la recherche0,0030,004
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0110,003

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,039
Tête enseignante GPT0,313
Écart entre enseignants0,274 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreProtocole

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations31
Publié2017
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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