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Enregistrement W2710916982 · doi:10.1093/botlinnean/box032

Molecular phylogenetics of annual Astragalus (Fabaceae) and its systematic implications

2017· article· en· W2710916982 sur OpenAlexafffund
Nasim Azani, Anne Bruneau, Martin F. Wojciechowski, Shahin Zarré

Notice bibliographique

RevueBotanical Journal of the Linnean Society · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant Ecology and Taxonomy Studies
Établissements canadiensUniversité du Québec à Montréal
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaIran National Science FoundationAlexander von Humboldt-Stiftung
Mots-clésFabaceaeBiologyAstragalusPhylogeneticsEvolutionary biologyMolecular phylogeneticsBotanyGeneticsGenePathology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Annual Astragalus spp. are important elements in the floras of Mediterranean areas of Africa, Europe and the deserts of South-West Asia. By reconstructing phylogenetic trees including c. 75% of Old World annual Astragalus spp. and representatives of allied perennial taxa, we sought novel evolutionary insights regarding the phylogenetic position and origins of these species. Our analyses of nuclear ribosomal DNA internal transcribed spacer and plastid trnK/matK sequences included 171 taxa of Astragalus plus nine outgroup taxa to recover the main clades in the genus. Character mapping for five selected morphological characters was conducted on the trees obtained, with a focus on the annual vs. perennial habit. Annual Astragalus spp. have originated in eight clades independently. Although the annual habit is the derived state in most clades recovered, at least two reversions to perenniality are found: one among the early branching lineages and another in the New World Astragalus clade. Our results suggest that the annual strategy has been an important force of selection leading to speciation in several clades of Astragalus and in different geographical areas. Geological events that have favoured the establishment of the annual habit in xeric habitats have probably also favoured the radiation of cushion-forming plants in the adjacent mountainous regions.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0020,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,023
Tête enseignante GPT0,230
Écart entre enseignants0,208 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations39
Publié2017
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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