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Enregistrement W2728213814 · doi:10.1128/jb.01489-10

Membrane Topology and Identification of Critical Amino Acid Residues in the Wzx O-Antigen Translocase from <i>Escherichia coli</i> O157:H7

2011· article· en· W2728213814 sur OpenAlexaff
Cristina L. Marolda, Бо Ли, Michael Lung, Mei Yang, Anna Hanuszkiewicz, Amanda Roa Rosales, Miguel A. Valvano

Notice bibliographique

RevueJournal of Bacteriology · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueBacteriophages and microbial interactions
Établissements canadiensWestern University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésGenBankBiologyAmino acidEscherichia coliFusion proteinPeptide sequenceMolecular biologyGeneticsGeneRecombinant DNA

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Volume 192, no. 23, p. 6160-6171, 2010. Page 6160: The title should appear as shown above. Page 6165: Fig. ​Fig.33 should appear as shown below. (The wzxEcO157 gene was obtained by PCR cloning from genomic DNA of strain UWO934-88, a clinical isolate of E. coli O157:H7 [Marolda et al., Microbiology 150:4095-4105, 2004], and its amino acid sequence is identical to that of GenBank accession no. AE005429_8. The amino acid sequence of WzxEcO157 includes an N-terminal fusion to the FLAG epitope. To construct this fusion, the first Met of wild-type WzxEcO157 was changed to Gly [position 1/13]. The amino acid numbers in the figure correspond to the original positions in the wild-type protein [Gly-13 corresponds to Met-1]. The tyrosine residue at position 319 in the original figure was misplaced, and its normal location is at position 253. The methionine at position 405 was displaced graphically but is actually located at the end of cytosolic loop 5.) FIG. 3. Page 6168: Table ​Table33 should appear as shown below (column heads have been corrected). TABLE 3.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,008

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,002

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,021
Tête enseignante GPT0,260
Écart entre enseignants0,239 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations4
Publié2011
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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