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Enregistrement W2728959095 · doi:10.1073/pnas.1620661114

Social and physical environments early in development predict DNA methylation of inflammatory genes in young adulthood

2017· article· en· W2728959095 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueProceedings of the National Academy of Sciences · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueBirth, Development, and Health
Établissements canadiensBC Children's HospitalUniversity of British ColumbiaCanadian Institute for Advanced Research
Organismes subventionnairesOffice of Extramural Research, National Institutes of HealthNational Heart, Lung, and Blood InstituteFogarty International CenterNational Science Foundation
Mots-clésEpigeneticsDNA methylationInflammationGeneBiologyPsychosocialMethylationGeneticsBioinformaticsImmunologyGene expressionPsychologyPsychiatry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Chronic inflammation contributes to a wide range of human diseases, and environments in infancy and childhood are important determinants of inflammatory phenotypes. The underlying biological mechanisms connecting early environments with the regulation of inflammation in adulthood are not known, but epigenetic processes are plausible candidates. We tested the hypothesis that patterns of DNA methylation (DNAm) in inflammatory genes in young adulthood would be predicted by early life nutritional, microbial, and psychosocial exposures previously associated with levels of inflammation. Data come from a population-based longitudinal birth cohort study in metropolitan Cebu, the Philippines, and DNAm was characterized in whole blood samples from 494 participants (age 20-22 y). Analyses focused on probes in 114 target genes involved in the regulation of inflammation, and we identified 10 sites across nine genes where the level of DNAm was significantly predicted by the following variables: household socioeconomic status in childhood, extended absence of a parent in childhood, exposure to animal feces in infancy, birth in the dry season, or duration of exclusive breastfeeding. To evaluate the biological significance of these sites, we tested for associations with a panel of inflammatory biomarkers measured in plasma obtained at the same age as DNAm assessment. Three sites predicted elevated inflammation, and one site predicted lower inflammation, consistent with the interpretation that levels of DNAm at these sites are functionally relevant. This pattern of results points toward DNAm as a potentially important biological mechanism through which developmental environments shape inflammatory phenotypes across the life course.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,185

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,048
Tête enseignante GPT0,334
Écart entre enseignants0,285 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle