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Enregistrement W2729938589 · doi:10.1139/cjb-2017-0042

A molecular investigation of Canadian Scytosiphonaceae (Phaeophyceae) including descriptions of <i>Planosiphon</i> gen. nov. and <i>Scytosiphon promiscuus</i> sp. nov.

2017· article· en· W2729938589 sur OpenAlexafffundvenueabout
Daniel C. McDevit, Gary W. Saunders

Notice bibliographique

RevueBotany · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineEarth and Planetary Sciences
ThématiqueMarine and coastal plant biology
Établissements canadiensUniversity of New Brunswick
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaCanada Research ChairsNew Brunswick Innovation FoundationParks CanadaGenome Canada
Mots-clésBiologyBotanyMonophylyPhylogenetic treeDNA barcodingZoologyCladeGeneGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Identification of macroalgae has been greatly facilitated by the use of molecular tools. Using the DNA barcode (COI-5P = 5′ end of cytochrome c oxidase 1), we have uncovered considerable genetic variation in Scytosiphon. Whereas only four species were recognized in North America [S. canaliculatus (Setchell &amp; N.L.Gardner) Kogame, S. complanatus (Rosenvinge) Doty, S. dotyi M.J.Wynne, and S. lomentaria (Lyngbye) Link], mitochondrial COI-5P data resolved 11 genetic groups while nuclear ITS data, in combination with morphological observations, supported recognition of seven species. These seven groups were assigned to: Scytosiphon Atlantic complex, S. sp._J, S. canaliculatus, S. complanatus, S. dotyi, S. lomentaria, and S. promiscuus sp. nov. One of the two species of Scytosiphon most commonly reported in North America, S. dotyi, was absent in Canada. Overlooked variation was also uncovered among Canadian collections of Colpomenia and Petalonia, indicating cryptic diversity in these scytosiphonacean genera as well. Multigene phylogenetic analyses supported the transfer of Petalonia zosterifolia (Reinke) Kuntz, Scytosiphon gracilis Kogame, and S. complanatus to Planosiphon gen. nov. Further, the included species of Chnoospora and Colpomenia failed to form monophyletic groups indicating that substantial taxonomic work remains for this brown algal family.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,238
Score d'incertitude au seuil0,659

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,028
Tête enseignante GPT0,212
Écart entre enseignants0,184 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations28
Publié2017
Routes d'admission4
Résumé présentoui

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