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Enregistrement W2734627099 · doi:10.1038/s41467-017-00031-7

Large meta-analysis of genome-wide association studies identifies five loci for lean body mass

2017· review· en· W2734627099 sur OpenAlexafffund
M. Carola Zillikens, Serkalem Demissie, Yi-Hsiang Hsu, Laura M. Yerges-Armstrong, Wen‐Chi Chou, Lisette Stolk, Gregory Livshits, Linda Broer, Toby Johnson, Daniel L. Koller, Zoltán Kutalik, Jian’an Luan, Ida Malkin, Janina S. Ried, Albert V. Smith, Guðmar Þorleifsson, Liesbeth Vandenput, Jing Hua Zhao, Weihua Zhang, Ali A. Aghdassi, Kristina Åkesson, Najaf Amin, Leslie J. Baier, Inês Barroso, David A. Bennett, Lars Bertram, Rainer Biffar, Murielle Bochud, Michael Boehnke, Ingrid B. Borecki, Aron S. Buchman, Liisa Byberg, Harry Campbell, Natalia Campos Obanda, Jane A. Cauley, Peggy M. Cawthon, Henna Cederberg, Zhao Chen, Nam H. Cho, Hyung Jin Choi, Melina Claussnitzer, Francis S. Collins, Steven R. Cummings, Philip L. De Jager, Ilja Demuth, R.A.M. Dhonukshe-Rutten, Luda Diatchenko, Guðný Eiríksdóttir, Anke W. Enneman, Mike Erdos, Johan G. Eriksson, Joel Eriksson, Karol Estrada, Daniel S. Evans, Mary F. Feitosa, Mao Fu, Melissa N. Garcia, Christian Gieger, Thomas Girke, Nicole L. Glazer, Harald Grallert, Jagvir Grewal, Bok-Ghee Han, Robert L. Hanson, Caroline Hayward, Albert Hofman, Eric P. Hoffman, Georg Homuth, Wen-Chi Hsueh, Monica J. Hubal, Alan Hubbard, Kim M. Huffman, Lise B. Husted, Thomas Illig, Erik Ingelsson, Till Ittermann, John-Olov Jansson, Joanne M. Jordan, Antti Jula, Magnus K. Karlsson, Kay‐Tee Khaw, Tuomas O. Kilpeläinen, Norman Klopp, Jacqueline S. L. Kloth, Heikki A. Koistinen, William E. Kraus, Stephen B. Kritchevsky, Teemu Kuulasmaa, Johanna Kuusisto, Markku Laakso, Jari Lahti, Thomas Lang, Bente Langdahl, Lenore J. Launer, Jong‐Young Lee, Markus M. Lerch, Joshua R. Lewis, Lars Lind, Cecilia M. Lindgren, Ching‐Ti Liu, Tian Liu, Youfang Liu, Östen Ljunggren, Mattias Lorentzon, Robert Luben, William Maixner, Fiona E. McGuigan, Carolina Medina‐Gómez, Thomas Meitinger, Håkan Melhus, Dan Mellström, Simon Melov, Karl Michaëlsson, Braxton D. Mitchell, Andrew P. Morris, Leif Mosekilde, Anne B. Newman, Carrie M. Nielson, Jeffrey R. O’Connell, Ben A. Oostra, Eric Orwoll, Aarno Palotie, Stephen C.J. Parker, Munro Peacock, Markus Perola, Annette Peters, Ozren Polašek, Richard L. Prince, Katri Räikkönen, Stuart H. Ralston, Samuli Ripatti, John A. Robbins, Jerome I. Rotter, Igor Rudan, Veikko Salomaa, Suzanne Satterfield, Eric E. Schadt, Sabine Schipf, Laura J. Scott, Joban Sehmi, Jian Shen, Chan Soo Shin, Gunnar Sigurðsson, Shad B. Smith, Nicole Soranzo, Alena Stančáková, Elisabeth Steinhagen–Thiessen, Elizabeth A. Streeten, Unnur Styrkársdóttir, Karin M. A. Swart, Sian-Tsung Tan, Mark A. Tarnopolsky, Cynthia A. Thomson, Unnur Þorsteinsdóttir, Emmi Tikkanen, Gregory J. Tranah, Jaakko Tuomilehto, Natasja M. van Schoor, Arjun Verma, Péter Vollenweider, Henry Völzke, Jean Wactawski‐Wende, Mark Walker, Michael N. Weedon, Ryan Welch, H.‐Erich Wichmann, Elisabeth Widén, Frances M. K. Williams, James F. Wilson, Nicole C. Wright, Weijia Xie, Lei Yu, Yanhua Zhou, John C. Chambers, Angela Döring, Cornelia M. van Duijn, Michael J. Econs, Vilmundur Guðnason, Jaspal S. Kooner, Bruce M. Psaty, Timothy D. Spector, Kāri Stefánsson, Fernando Rivadeneira, André G. Uitterlinden, Nicholas J. Wareham, Vicky Ossowski, Dawn Waterworth, Ruth J. F. Loos, David Karasik, Tamara B. Harris, Claes Ohlsson, Douglas P. Kiel

Notice bibliographique

RevueNature Communications · 2017
Typereview
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic Associations and Epidemiology
Établissements canadiensMcMaster University Medical CentreMcGill University
Organismes subventionnairesNational Center for Advancing Translational SciencesU.S. National Library of MedicineNational Institute of Neurological Disorders and StrokeNational Institute of Diabetes and Digestive and Kidney DiseasesNational Institute on AgingMünchner Zentrum für GesundheitswissenschaftenKorea Centers for Disease Control and PreventionNational Health and Medical Research CouncilCanadian Institutes of Health ResearchSchool of Medicine, Johns Hopkins UniversityNational Center for Research ResourcesNational Institute of General Medical SciencesCenters for Disease Control and PreventionNational Institutes of HealthArmy Research OfficeUniversität GreifswaldChinese Society of Clinical OncologyMedical Research CouncilUppsala UniversitetNational Institute of Arthritis and Musculoskeletal and Skin DiseasesGreta och Johan Kocks stiftelserGöteborgs LäkaresällskapSydäntutkimussäätiöAkademiska SjukhusetVetenskapsrådetU.S. Department of Health and Human ServicesGlaxoSmithKlineSigne ja Ane Gyllenbergin SäätiöCentre for Medical Systems BiologyGenome CanadaNovo NordiskFP7 People: Marie-Curie ActionsAmerican Diabetes AssociationVrije Universiteit AmsterdamKaren Elise Jensens FondSvenska LäkaresällskapetDeutsche ForschungsgemeinschaftNederlandse Organisatie voor Wetenschappelijk OnderzoekBritish Heart FoundationBundesministerium für Bildung und ForschungJohns Hopkins UniversityUniversität zu LübeckKing's College LondonAcademy of FinlandMinisterie van Economische Zaken, Landbouw en InnovatieDiabetestutkimussäätiöZonMwSchweizerischer Nationalfonds zur Förderung der Wissenschaftlichen ForschungNederlandse Zuivel OrganisatieErasmus Medisch CentrumMax-Planck-Institut für BildungsforschungStiftelsen för Strategisk ForskningVersus ArthritisHealthwayMalmö HögskolaEuropean Science FoundationNational Human Genome Research InstituteDanmarks Frie ForskningsfondKidney Research UKRoyal SocietyNational Institute for Health and Care ResearchWageningen University and ResearchCancer Research UKWellcome TrustNational Heart, Lung, and Blood InstituteItä-Suomen YliopistoFoundation for Cardiovascular ResearchFinska LäkaresällskapetYrjö Jahnssonin SäätiöAstraZenecaEuropean CommissionHelsingin YliopistoSchool of Medicine, Boston UniversityChronic Disease Research FoundationKuopion Yliopistollinen SairaalaWake Forest UniversityScottish GovernmentHjartaverndIllinois Department of Public HealthCedars-Sinai Medical CenterMinistry of Cultural AffairsEmil Aaltosen SäätiöNational Science FoundationJuho Vainion SäätiöNovo Nordisk FondenAmerican Heart Association
Mots-clésGenome-wide association studyGeneticsBiologyGenomeComputational biologyMeta-analysisAssociation (psychology)MedicineGeneGenotypeSingle-nucleotide polymorphismPsychology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Lean body mass, consisting mostly of skeletal muscle, is important for healthy aging. We performed a genome-wide association study for whole body (20 cohorts of European ancestry with n = 38,292) and appendicular (arms and legs) lean body mass ( n = 28,330) measured using dual energy X-ray absorptiometry or bioelectrical impedance analysis, adjusted for sex, age, height, and fat mass. Twenty-one single-nucleotide polymorphisms were significantly associated with lean body mass either genome wide ( p < 5 × 10 −8 ) or suggestively genome wide ( p < 2.3 × 10 −6 ). Replication in 63,475 (47,227 of European ancestry) individuals from 33 cohorts for whole body lean body mass and in 45,090 (42,360 of European ancestry) subjects from 25 cohorts for appendicular lean body mass was successful for five single-nucleotide polymorphisms in/near HSD17B11, VCAN, ADAMTSL3 , IRS1 , and FTO for total lean body mass and for three single-nucleotide polymorphisms in/near VCAN , ADAMTSL3 , and IRS1 for appendicular lean body mass. Our findings provide new insight into the genetics of lean body mass.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,010
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMétarecherche, Méta-épidémiologie (sens strict), Intégrité de la recherche
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Méta-analyse · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,694
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,010
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0030,004
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0020,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,159
Tête enseignante GPT0,449
Écart entre enseignants0,290 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeMéta-analyse
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations187
Publié2017
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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