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Enregistrement W2736169138

Inhibition of TDP-43 Aggregation using Native State Binding Ligands

2014· dissertation· en· W2736169138 sur OpenAlexfundno aff
Yulong Sun

Notice bibliographique

RevueTSpace · 2014
Typedissertation
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAmyotrophic Lateral Sclerosis Research
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesAlzheimer's SocietyGovernment of Ontario
Mots-clésPathogenesisFrontotemporal lobar degenerationProtein aggregationOligonucleotideInclusion bodiesIn vitroAmyotrophic lateral sclerosisChemistryCell biologyBiologyRecombinant DNABiochemistryDNAMedicineGeneDiseaseFrontotemporal dementiaImmunologyPathology
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

TAR DNA binding protein of 43 kDa (TDP-43) has been implicated in the pathogenesis of amyotrophic lateral sclerosis and frontotemporal lobar degeneration. Pathologically misfolded and aggregated forms of TDP-43 are found in cytoplasmic inclusion bodies of affected neurons in these diseases. The mechanism by which TDP-43 misfolding causes disease is not well understood. We postulate that the aggregation process plays a major role in pathogenesis, and we hypothesize that oligonucleotide ligands of TDP-43 can stabilize the native functional state of the protein and ameliorate aggregation of this aggregation-prone protein. Using recombinant TDP-43 we were able to examine the extent to which various oligonucleotide molecules affects its aggregation in vitro. We have found that certain natural sequence and de novo designed oligonucleotides bind TDP-43 and prevent its natural tendency to aggregate. The clinical and therapeutic implications of these findings are discussed.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,022
Score d'incertitude au seuil0,816

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,045
Tête enseignante GPT0,385
Écart entre enseignants0,340 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2014
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Résumé présentoui

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