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Enregistrement W2740847816 · doi:10.7554/elife.23783

A sharp Pif1-dependent threshold separates DNA double-strand breaks from critically short telomeres

2017· article· en· W2740847816 sur OpenAlexafffund
Jonathan Strecker, Sonia Stinus, Mariana Pliego Caballero, Rachel K. Szilard, Michael Chang, Daniel Durocher

Notice bibliographique

RevueeLife · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueTelomeres, Telomerase, and Senescence
Établissements canadiensLunenfeld-Tanenbaum Research InstituteUniversity of TorontoMount Sinai Hospital
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchKrembil FoundationNederlandse Organisatie voor Wetenschappelijk Onderzoek
Mots-clésTelomereTelomeraseBiologyDNATelomerase RNA componentCell biologyMolecular biologyGeneticsTelomerase reverse transcriptaseGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

DNA double-strand breaks (DSBs) and short telomeres are structurally similar, yet they have diametrically opposed fates. Cells must repair DSBs while blocking the action of telomerase on these ends. Short telomeres must avoid recognition by the DNA damage response while promoting telomerase recruitment. In Saccharomyces cerevisiae, the Pif1 helicase, a telomerase inhibitor, lies at the interface of these end-fate decisions. Using Pif1 as a sensor, we uncover a transition point in which 34 bp of telomeric (TG1-3)n repeat sequence renders a DNA end insensitive to Pif1 action, thereby enabling extension by telomerase. A similar transition point exists at natural chromosome ends, where telomeres shorter than ~40 bp are inefficiently extended by telomerase. This phenomenon is not due to known Pif1 modifications and we instead propose that Cdc13 renders TG34+ ends insensitive to Pif1 action. We contend that the observed threshold of Pif1 activity defines a dividing line between DSBs and telomeres.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict), Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,060
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,048
Tête enseignante GPT0,335
Écart entre enseignants0,287 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations28
Publié2017
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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