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Enregistrement W2741843236 · doi:10.1038/s41598-017-07613-x

Standardization of electroencephalography for multi-site, multi-platform and multi-investigator studies: insights from the canadian biomarker integration network in depression

2017· article· en· W2741843236 sur OpenAlexafffundabout
Faranak Farzan, Sravya Atluri, Matthew Frehlich, Prabhjot Dhami, Killian Kleffner, Rae Price, Raymond W. Lam, Benício N. Frey, Roumen Milev, Arun Ravindran, Mary Pat McAndrews, Willy Wong, Daniel M. Blumberger, Zafiris J. Daskalakis, Fidel Vila‐Rodriguez, Alonso Esther, Colleen A. Brenner, Mario Liotti, Moyez Dharsee, Stephen R. Arnott, Kenneth Evans, Susan Rotzinger, Sidney H. Kennedy

Notice bibliographique

RevueScientific Reports · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueFunctional Brain Connectivity Studies
Établissements canadiensSt. Michael's HospitalBaycrest HospitalMcMaster UniversityIndoc ResearchCanada Research ChairsQueen's UniversitySt. Joseph’s Healthcare HamiltonUniversity of British ColumbiaSimon Fraser UniversityUniversity Health NetworkUniversity of TorontoVancouver Coastal HealthCentre for Addiction and Mental Health
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchH. Lundbeck A/SGovernment of OntarioNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaPfizerServierOntario Brain Institute
Mots-clésStandardizationComputer scienceData scienceDocumentationData integrationToolboxNeuroinformaticsData collectionPreprocessorElectroencephalographyData miningArtificial intelligenceNeurosciencePsychology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Subsequent to global initiatives in mapping the human brain and investigations of neurobiological markers for brain disorders, the number of multi-site studies involving the collection and sharing of large volumes of brain data, including electroencephalography (EEG), has been increasing. Among the complexities of conducting multi-site studies and increasing the shelf life of biological data beyond the original study are timely standardization and documentation of relevant study parameters. We present the insights gained and guidelines established within the EEG working group of the Canadian Biomarker Integration Network in Depression (CAN-BIND). CAN-BIND is a multi-site, multi-investigator, and multi-project network supported by the Ontario Brain Institute with access to Brain-CODE, an informatics platform that hosts a multitude of biological data across a growing list of brain pathologies. We describe our approaches and insights on documenting and standardizing parameters across the study design, data collection, monitoring, analysis, integration, knowledge-translation, and data archiving phases of CAN-BIND projects. We introduce a custom-built EEG toolbox to track data preprocessing with open-access for the scientific community. We also evaluate the impact of variation in equipment setup on the accuracy of acquired data. Collectively, this work is intended to inspire establishing comprehensive and standardized guidelines for multi-site studies.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,139
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,193
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,797
Score d'incertitude au seuil0,737

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,1390,193
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0050,009
Études des sciences et des technologies0,0050,005
Communication savante0,0060,003
Science ouverte0,0060,008
Intégrité de la recherche0,0010,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,112
Tête enseignante GPT0,330
Écart entre enseignants0,218 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations53
Publié2017
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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