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Enregistrement W2741945807 · doi:10.1158/1538-7445.am2017-4336

Abstract 4336: Human mesodermal-derived CNS metastasis-associated stromal cells induce a fibrotic response to limit tumor growth

2017· article· en· W2741945807 sur OpenAlexaff
Christophe Legendre, Gerald Gooden, Kyle N. Johnson, Rae Anne Martinez, Mark Bernstein, Jennifer Glen, Jeffrey Kiefer, Aleksander Hinek, Steven A. Toms, Bodour Salhia

Notice bibliographique

RevueCancer Research · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueBrain Metastases and Treatment
Établissements canadiensSickKids FoundationUniversity Health Network
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyStromal cellCancer researchDNA methylationMetastasisEpigeneticsMesenchymal stem cellSomatic cellExtracellular matrixCancerPathologyTGFBICell biologyGeneMedicineGene expressionGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Metastasis to the central nervous system (CNS) remains a major cause of mortality and morbidity in patients with systemic cancer. However, the mechanistic interactions of the neural niche with disseminated tumors cells in CNS metastases (CM) are still poorly understood. To better understand the cross-talk between the neural niche and metastatic tumors, we generated five different patient-derived cell lines (PDCs) originating from surgically resected CM. To assess the genetic and epigenetic characteristics of each PDC, DNA and RNA sequencing, and DNA methylation analysis was performed. Non-tumoral PDCs revealed normal copy number profiles, and retention of germline mutations as seen in patient-matched germline DNA. In contrast, one PDC (CM04) resembled its patient tumor, showing numerous copy number and somatic alterations. RNA-seq and DNA methylation analysis demonstrated that non-tumoral PDCs highly resembled each other, suggestive of a common cell of origin. Additionally, PDCs revealed gene expression signatures associated with cancer associated fibroblasts, epithelial to mesenchymal transition, and mesenchymal stem cells. Further in vivo studies demonstrated that CM04 cells were tumorigenic, whereas non-tumoral PDC (CM08) cells were unable to form tumors in mice. However, CM04:CM08 mixed tumors were significantly smaller than CM04 only tumors and revealed induction of a fibrotic response by immunohistochemistry. These data offer the first evidence that CNS metastasis-associated stromal cells (cMASCs) produce a collagen and fibronectin-rich extracellular matrix constituting a protective host response, which impedes growth of tumor cells. The therapeutic potential of these cells merits further exploration. Citation Format: Christophe Legendre, Gerald C. Gooden, Kyle N. Johnson, Rae Anne Martinez, Mark Bernstein, Jennifer Glen, Jeffrey Kiefer, Aleksander Hinek, Steven A. Toms, Bodour Salhia. Human mesodermal-derived CNS metastasis-associated stromal cells induce a fibrotic response to limit tumor growth [abstract]. In: Proceedings of the American Association for Cancer Research Annual Meeting 2017; 2017 Apr 1-5; Washington, DC. Philadelphia (PA): AACR; Cancer Res 2017;77(13 Suppl):Abstract nr 4336. doi:10.1158/1538-7445.AM2017-4336

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,010

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,151
Tête enseignante GPT0,438
Écart entre enseignants0,287 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2017
Routes d'admission1
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