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Enregistrement W2741989542 · doi:10.3390/ijms18081679

Do Multiwell Plate High Throughput Assays Measure Loss of Cell Viability Following Exposure to Genotoxic Agents?

2017· article· en· W2741989542 sur OpenAlexaff
Razmik Mirzayans, Bonnie Andrais, David Murray

Notice bibliographique

RevueInternational Journal of Molecular Sciences · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
Thématiquebioluminescence and chemiluminescence research
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésFormazanViability assayCytotoxicityCell culturePlate readerCisplatinBiologyMicrotiter plateCell growthMTT assayRadiosensitivityHigh-content screeningHigh-throughput screeningNeutral redChemosensitivity assayGentamicin protection assayCellChemistryMolecular biologyBiochemistryIn vitroChemotherapyFluorescenceMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Cell-based assays in multiwell plates are widely used for radiosensitivity and chemosensitivity assessment with different mammalian cell types. Despite their relative ease of performance, such assays lack specificity as they do not distinguish between the cytostatic (reversible/sustained growth arrest) and cytotoxic (loss of viability) effects of genotoxic agents. We recently reported studies with solid tumor-derived cell lines demonstrating that radiosensitivity as measured by multiwell plate colorimetric (e.g., XTT) and fluorimetric (e.g., CellTiter-Blue) assays reflects growth arrest but not loss of viability. Herein we report similar observations with cancer cell lines expressing wild-type p53 (A549 lung carcinoma) or mutant p53 (MDA–MB-231 breast carcinoma) after treatment with the chemotherapeutic drug cisplatin. Importantly, we show that treatment of cancer cells with concentrations of cisplatin that result in 50% effect (i.e., IC50) in multiwell plate assays trigger the emergence of growth arrested cells that exhibit highly enlarged morphology, remain viable and adherent to the culture dish, and metabolize the tetrazolium salt 3-(4,5-dimethylthiazol-2-yl)-2,5-diphenyl-tetrazolium bromide (MTT) to its formazan derivative. The emergence of markedly enlarged viable cells complicates the interpretation of chemosensitivity data obtained with multiwell plate high throughput assays. Relying solely on IC50 values could be misleading.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,015
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,018
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,015
Score d'incertitude au seuil0,080

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0150,018
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0030,002
Méta-épidémiologie (sens large)0,0050,001
Bibliométrie0,0030,004
Études des sciences et des technologies0,0010,002
Communication savante0,0050,006
Science ouverte0,0040,001
Intégrité de la recherche0,0050,005
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,006

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,025
Tête enseignante GPT0,328
Écart entre enseignants0,303 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations31
Publié2017
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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