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Enregistrement W2742480325 · doi:10.2527/asasann.2017.043

043 Metabolomics uncovers serum biomarkers that can predict the risk of retained placenta in transition dairy cows

2017· article· en· W2742480325 sur OpenAlexaff
Elda Dervishi, Guanshi Zhang, Raju K. Mandal, David S. Wishart, Burim N. Ametaj

Notice bibliographique

RevueJournal of Animal Science · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueReproductive Physiology in Livestock
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésIce calvingRetained placentaMetabolomicsMetaboliteMorningChemistryMetabolomePlacentaBrahmanSphingomyelinAndrologyLiquid chromatography–mass spectrometryEndocrinologyAnimal scienceInternal medicinePregnancyChromatographyFetusBiologyMedicineLactationBiochemistryMass spectrometryBreed

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

A combination of direct injection and tandem mass spectrometry with a reverse-phase liquid chromatography and tandem mass spectrometry was used to detect serum metabolite signatures in 20 cows that expelled their fetal membranes normally and 6 cows that retained placenta. We aimed to identify serum biomarkers that can predict the risk of retained placenta (RP) in transition dairy cows. Blood samples were obtained from the coccygeal vein once per week at 0700 h before the morning feeding at 8 and 4 wk before parturition, at the week of RP, and at 4 and 8 wk postpartum. We studied perturbation of serum metabolites using an AbsoluteIDQ 180 kit (BIOCRATES Life Science AG, Innsbruck, Austria), which contained metabolites related to AA, acylcarnitines, biogenic amines, glycerophospholipids, sphingolipids, and hexose. Univariate analysis of data was performed using Wilcoxon–Mann–Whitney test provided by R (version 3.0.3; 2008). Metabolomic data were analyzed using the MetaboAnalyst software. Statistical significance was declared at P < 0.05. Results showed that cows with RP were characterized by a decrease in lysophosphatidylcholine (LysoPC) a C18:2, C20:3, C20:4, C28:0, and C28:1 at 8 wk before parturition and during the week of diagnosis of RP (P < 0.01). At 4 wk prior to calving, LysoPC a C20:4 and C28:0 were decreased. Concentrations of phosphatidylcholines (PC) changed after calving, with 12 and 4 species of PC elevated at 4 and 8 wk after calving, respectively (P < 0.05). Cows with RP were characterized by increased concentrations of sphingomyelins in the serum at 8 wk prior to parturition (P < 0.05), the week of RP (P < 0.05), and at 4 and 8 wk after parturition (P < 0.05). Amino acids Lys, Ile, and Leu were greater in cows diagnosed with RP during all experimental time. Biogenic amines, acetylornithine, asymmetric dimethylarginine, total dimethylarginine, carnosine, creatinine, and sarcosine were greater in RP cows during diagnosis week (P < 0.01). It is intriguing that pre-RP, RP, and post-RP cows showed an increased concentration of Lys, Ile, Leu, and acetylornithine during all experimental time points studied (P < 0.01). Moreover, LysoPC a C20:4 and C28:0, ornithine, and Asn decreased before parturition and at the disease diagnosis week (P < 0.05). In conclusion, RP is preceded by and associated with alterations in multiple species of AC, PC, LPC, AA, and BA starting from 8 wk prior to parturition. Alterations of serum Lys, ornithine, acetylornithine, LysoPC a C28:0, Asp, Leu, and Ile might be novel serum biomarkers for prediction of risk of RP in dairy cows.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,026
Tête enseignante GPT0,250
Écart entre enseignants0,224 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations6
Publié2017
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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