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Enregistrement W2743320327 · doi:10.1101/174490

Committed Hemopoietic Progenitors, Not Stem Cells, are the Principal Responders to Hox Gene Transduction

2017· preprint· en· W2743320327 sur OpenAlexafffund
Harvey Lim, Salima Janmohamed, Patricia Benveniste, Robert Herrington, Mary Barbara, Catherine Frelin, Deborah Hyam, Christopher J. Paige, Juan Carlos Zúñiga‐Pflücker, Carol Stocking, Jana Krošl, Guy Sauvageau, Norman N. Iscove

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2017
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueEpigenetics and DNA Methylation
Établissements canadiensUniversité de MontréalInstitute for Research in Immunology and CancerPrincess Margaret Cancer CentreSunnybrook HospitalUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchTerry Fox FoundationPrincess Margaret Hospital FoundationStem Cell NetworkCancer Research Institute
Mots-clésBiologyHox geneHaematopoiesisStem cellProgenitor cellEndogenyCell biologyHomeoboxGeneGeneticsGene expression

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

ABSTRACT As hemopoietic stem cells differentiate, their proliferative lifespan shortens by unknown mechanisms. Homeobox cluster (Hox) genes have been implicated by their enhancement of self-renewal when transduced into hemopoietic cells, but gene deletions have been inconclusive because of functional redundancy. Here we enforced HOXB4 expression in purified precursor stages, and compared responses of early stages expressing the endogenous genes with later stages that did not. Contrary to the prevalent view that transduced Hox genes enhance the self-renewal of hemopoietic stem cells, stem cells or their multipotent progeny expressing the endogenous genes showed little response. Instead, immortalization, extensive self-renewal and acquired reconstituting potential occurred in committed erythroid and myeloid progenitors where the endogenous genes were shutting down. The results change our understanding of the stages affected by exogenous HOX proteins and point to shutdown of the endogenous genes as a principal determinant of the shortened clonal lifespans of committed progenitor cells.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,021
Tête enseignante GPT0,241
Écart entre enseignants0,219 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2017
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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