Crucial genes at the onset of lactation revealed by transcriptome screening of Domestic Yak mammary gland
Notice bibliographique
Résumé
At the onset of lactation, there are three distinct stages of mammary tissue development and function including mammogenesis, colostrogenesis, and lactogenesis. The mechanism of the transition from colostrogenesis to lactogenesis of Maiwa Yak is still unknown. In this study, mammary tissues from three Maiwa Yaks were collected at 1 and 30 d after parturition for transcriptome exploration using Affymetrix Bovine Genome Arrays. Comparing 1 and 30 d results, a total of 517 annotated differentially expressed genes (DEGs) were identified at the criteria of a P ≤ 0.05. The ratio of up-regulated genes to the down-regulated ones was around 1:2 (more specifically, 164:353). To depict the profile of DEGs, a dynamic impact approach (DIA) was used to analyse the microarray data based on Gene Ontology (GO) and Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes (KEGG) databases. GO terms “fatty acid transport” and “monocarboxylic acid transport” were significantly induced during the colostrum period. The strongly impacted KEGG pathways were “chondroitin sulfate biosynthesis”, “glycosphingolipid biosynthesis”, and “glycerolipid metabolism”. These data may provide candidate genes with a high probability of having functional roles in regulating the transition from colostrum to normal milk in domestic yak mammary gland.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».