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Enregistrement W2748501556

Investigating Potentially Key Residues Which Imparts the Substrate and Regiospecifi city of aFlavonol-Specifi c 3-O-Glucosyltransferase from Grapefruit

2013· article· en· W2748501556 sur OpenAlexfundno aff
Olusegun A. Adepoju, Devaiah P. Shivakumar, Cecelia A. McIntosh

Notice bibliographique

RevueDigital Commons - East Tennessee State University (East Tennessee State University) · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePlant Gene Expression Analysis
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaNational Academy of SciencesHunan Agricultural UniversityUniversity of OxfordConcordia UniversityNational Natural Science Foundation of ChinaBrock UniversityCanada Research ChairsGenome Canada
Mots-clésGlucosyltransferaseKey (lock)Citrus paradisiSubstrate (aquarium)ChemistryBiochemistryFood scienceBiologyBotanyEnzymeEcologyRutaceae
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Most naturally-occurring fl avonoids are found in glucosylated form. Glucosyltransferases (GTs) are enzymes that catalyze the transfer of glucose from a high energy sugar donor to an acceptor molecule. Citrus paradisi fl avonol-specifi c glucosyltransferase (Cp-F3-O-GT) is recognized for its rigid substrate and regiospecifi city. In this work, homology modeling, site-directed mutagenesis, and biochemical analyses of the recombinant mutant Cp-F3-O-GT proteins were used to investigate potential amino acid residues that might be responsible for the enzymes strict regiospecifi city while also investigating its substrate specifi city. The single point mutations of three amino acid residues within the grapefruit F3-O-GT identifi ed through sequence alignment and homology modeling were performed. Analyses of the enzyme activity of the recombinant mutant F3-O-GT proteins revealed that the single point mutations of serine 20 to leucine (S20L) and proline 297 to phenylalanine (P297F) rendered the recombinant enzymes inactive with fl avonol substrates at 6% and 12% respectively relative to wild-type. However, the mutation of glycine 392 to glutamate (G392E) remained active and glucosylated the fl avonol acceptors quercein (Km app= 11 μM; Vmax = 5.7 pKat/μg) relative to the wild-type (Km app= 93 μM; Vmax = 41.7 pKat/μg), and kaempferol (Km app= 7 μM; Vmax = 3.8 pKat/μg) relative to the wild-type (Km app = 39 μM; Vmax = 4.2 pKat/ μg). The mutant enzyme also did not show broadened acceptor substrate specifi city as it also favored fl avonols as the preferred acceptor substrate. The optimum pH of the mutant enzyme was 8.0 similar to the wild-type F3-O-GT. Activity of the mutant enzyme was stimulated by NaCl and KCl, but inhibited by Cu2+, Zn2+, Fe2+ as well as UDP with an apparent Ki of 10μM. Product identifi cation to determine glucosylation position is being investigated for a possible change in regiospecifi city.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,566
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,176
Écart entre enseignants0,164 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2013
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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