DNA Aptamer–Target Binding Motif Revealed Using a Fluorescent Guanine Probe: Implications for Food Toxin Detection
Pourquoi ce travail est dans la base
Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.
Notice bibliographique
Résumé
DNA aptamers are single-stranded oligonucleotides that are generated by an in vitro selection method to bind targets with high affinity and specificity. Understanding molecular recognition by DNA aptamers is of fundamental importance in the development of biosensor applications. The small molecule ochratoxin A (OTA) is a fungal-derived food toxin, and OTA DNA aptamers have been established for the development of rapid detection platforms required for food safety. One such OTA aptamer (OTAA) is a guanine-rich DNA oligonucleotide that folds into an antiparallel G-quadruplex (GQ) upon OTA binding, although structural details of the GQ fold and its interaction with OTA are currently unknown. In the present study, the fluorescent nucleobase analogue, 8-thienyl-2'-deoxyguanosine (ThdG), was inserted into various G sites of OTAA to determine the probe impact on GQ folding and OTA binding affinity. Our results suggest that OTAA contains three lateral (l) loops connecting two stacked G-tetrads with an anticlockwise loop progression to afford a -(lll) GQ topology. The phenolic ring system of OTA undergoes π-stacking interactions with the G-tetrads of OTAA. Our results also demonstrate aptamer sites that can be modified with ThdG to afford a fluorescent light-up signal upon OTA binding.
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Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle