Clonal characteristics of paired infiltrating and circulating B lymphocyte repertoire in patients with primary biliary cholangitis
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND: PBC is a prototypical autoimmune liver disease characterized by portal lymphoplasmacyte infiltration. ALD is a prototypical environment-driven disease, featured by mild lymphocyte infiltration. We hypothesize that B cells are more involved in the pathogenesis of PBC. By analysing the infiltrating B cell repertoire, we aimed to unveil greater oligoclonal expansion and active clonal exchange between liver and periphery in PBC than in ALD patients. METHODS: Using NGS of Ig H chain genes, we analysed the liver-infiltrating and paired peripheral B lymphocyte repertoire from nine PBC and four ALD patients. RESULTS: In the liver of PBC and ALD patients, (i) roughly 10% of the B lymphocytes were clonally related and highly expressed, and there were also lineages that underwent extensive clonal expansion; (ii) there was different use of IGHV/IGHJ segments between PBC and ALD, suggesting distinct Ag exposure backgrounds, but this did not lead to a significant difference in their clonal expansion level. Analysis of data sets from paired samples further revealed, (iii) direct clonal exchange and evolutionally related B cell clones between the infiltrating and peripheral repertoire; (iv) the seeding of the infiltrating clones to periphery, and peripheral ones to the liver, for further extensive evolution. CONCLUSIONS: The oligoclonally expanded nature of the infiltrating B cell repertoire implies B cell immunity is involved in the pathogenesis of both diseases. The observed clonal exchange might provide an approach to identify and monitor the infiltrating B cells through the periphery.
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Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».