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Enregistrement W2749838627

Adaptation to European latitudes through assimilation of wild diversity at the LuTFL1 locus altered architecture and promoted fiber production in flax.

2017· preprint· en· W2749838627 sur OpenAlexaff
Rafał M. Gutaker, Maricris Zaidem, Yong‐Bi Fu, Axel Diederichsen, Oliver Smith, Roselyn Ware, Robin G. Allaby

Notice bibliographique

Revuenon disponible
Typepreprint
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueSoybean genetics and cultivation
Établissements canadiensPlant Biotechnology Institute
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésDomesticationBiologyAlleleLocus (genetics)Adaptation (eye)Genetic architectureLocal adaptationGenetic diversityLatitudePopulationGeneGeneticsBotanyEvolutionary biologyQuantitative trait locusGeography
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

After domestication in the Near East around 10,000 years ago several founder crops spread and adapted to European latitudes. On reaching northerly latitudes the architecture of domesticated flax changed becoming more suitable to fiber production over oil, with longer stems, smaller seeds and fewer axillary branches. Latitudinal adaptations in crops typically result in changes in flowering time, often involving the PEBP family of genes that also have the potential to influence plant architecture. We identify PEBP family genes in the flax genome, describe molecular diversity of two loci, LuTFL1 and LuTFL2 in wild and cultivated flax that vary over latitudinal range, and show that cultivated flax received LuTFL1 alleles from more northerly wild flax populations. Compared to a genomic background of population structure of flaxes over latitude determined using restriction site-associated loci, the LuTFL1 alleles display a level of differentiation that is consistent with selection both for a northern associated allele (III) and against a southern associated allele (I) in the north. We also demonstrate that LuTFL1 alleles are associated with differing flowering time, and through heterologous expression in Arabidopsis thaliana that LuTFL1 is a functional homolog of TFL1 in Arabidopsis thaliana and is capable of changing both flowering time and plant architecture. We conclude that specialized fiber flax types formed as a consequence of a natural adaptation of cultivated flax to higher latitudes.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,915
Score d'incertitude au seuil0,351

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,057
Tête enseignante GPT0,243
Écart entre enseignants0,185 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2017
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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