Aldehyde dehydrogenase 1B1: a novel immunohistological marker for colorectal cancer
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND: Aldehyde dehydrogenase (ALDH) 1A1 is an immunohistological biomarker of various solid tumours, but has not been successfully proved as a colorectal cancer (CRC) marker. We recently reported that ALDH1B1, which has functional roles in tumourigenesis, may be a better CRC marker than ALDH1A1. METHODS: Human CRC explants and cell lines were analysed to identify candidate CRC markers from eight ALDH isozymes including ALDH1A1 and ALDH1B1. A tissue microarray, including paired specimens of normal and tumour tissues, was subsequently analysed to determine if candidate ALDHs could distinguish CRC from normal tissue. RESULTS: cells), while other ALDHs, including ALDH1A1, showed differential or low expression. No genetic alteration of ALDH1B1 in CRC was suggested by the relationships between mRNA and protein levels/enzymatic activities, and cDNA sequences of CRC cell lines. Tissue microarray findings showed that ALDH1B1, but not ALDH2, could distinguish CRC from normal tissue. Furthermore, ratios of ALDH1B1 to ALDH1A1 or ALDH2 were found to be powerful CRC indicators. CONCLUSIONS: These results suggest that ALDH1B1 is a novel human CRC biomarker.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».