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Enregistrement W2750886030 · doi:10.1074/jbc.m117.806893

Negatively charged residues in the first extracellular loop of the L-type CaV1.2 channel anchor the interaction with the CaVα2δ1 auxiliary subunit

2017· article· en· W2750886030 sur OpenAlexafffund
Benoîte Bourdin, Julie Briot, Marie-Philippe Tétreault, Rémy Sauvé, Lucie Parent

Notice bibliographique

RevueJournal of Biological Chemistry · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueIon channel regulation and function
Établissements canadiensUniversité de MontréalMontreal Heart Institute
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchHeart and Stroke Foundation of Canada
Mots-clésCav1.2ExtracellularImmunoprecipitationProtein subunitGatingXenopusChemistryIntracellularBiophysicsCell biologyBiochemistryBiologyGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Voltage-gated L-type Ca V 1.2 channels in cardiomyocytes exist as heteromeric complexes. Co-expression of Ca V α2δ1 with Ca V β/Ca V α1 proteins reconstitutes the functional properties of native L-type currents, but the interacting domains at the Ca V 1.2/Ca V α2δ1 interface are unknown. Here, a homology-based model of Ca V 1.2 identified protein interfaces between the extracellular domain of Ca V α2δ1 and the extracellular loops of the Ca V α1 protein in repeats I (IS1S2 and IS5S6), II (IIS5S6), and III (IIIS5S6). Insertion of a 9-residue hemagglutinin epitope in IS1S2, but not in IS5S6 or in IIS5S6, prevented the co-immunoprecipitation of Ca V 1.2 with Ca V α2δ1. IS1S2 contains a cluster of three conserved negatively charged residues Glu-179, Asp-180, and Asp-181 that could contribute to non-bonded interactions with Ca V α2δ1. Substitutions of Ca V 1.2 Asp-181 impaired the co-immunoprecipitation of Ca V β/Ca V 1.2 with Ca V α2δ1 and the Ca V α2δ1-dependent shift in voltage-dependent activation gating. In contrast, single substitutions in Ca V 1.2 in neighboring positions in the same loop (179, 180, and 182–184) did not significantly alter the functional up-regulation of Ca V 1.2 whole-cell currents. However, a negatively charged residue at position 180 was necessary to convey the Ca V α2δ1-mediated shift in the activation gating. We also found a more modest contribution from the positively charged Arg-1119 in the extracellular pore region in repeat III of Ca V 1.2. We conclude that Ca V 1.2 Asp-181 anchors the physical interaction that facilitates the Ca V α2δ1-mediated functional modulation of Ca V 1.2 currents. By stabilizing the first extracellular loop of Ca V 1.2, Ca V α2δ1 may up-regulate currents by promoting conformations of the voltage sensor that are associated with the channel's open state.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,014

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,035
Tête enseignante GPT0,265
Écart entre enseignants0,230 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations21
Publié2017
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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