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Enregistrement W2750976484 · doi:10.1021/acs.jproteome.7b00430

Primary Metabolism and Medium-Chain Fatty Acid Alterations Precede Long-Chain Fatty Acid Changes Impacting Neutral Lipid Metabolism in Response to an Anticancer Lysophosphatidylcholine Analogue in Yeast

2017· article· en· W2750976484 sur OpenAlexafffund
Nicolas Pietro Tambellini, Vanina Zaremberg, Saikumari Krishnaiah, Raymond J. Turner, Aalim M. Weljie

Notice bibliographique

RevueJournal of Proteome Research · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMetabolomics and Mass Spectrometry Studies
Établissements canadiensUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaAmerican Cancer Society
Mots-clésLysophosphatidylcholineBiochemistryFatty acidFatty acid metabolismMetabolismLipid metabolismLipidomicsBiologyButyrateMetabolic pathwayMetabolomeDiacylglycerol kinaseInositolPhospholipidChemistryPhosphatidylcholineMetaboliteSignal transductionMembraneFermentation

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The nonmetabolizable lysophosphatidylcholine (LysoPC) analogue edelfosine is the prototype of a class of compounds being investigated for their potential as selective chemotherapeutic agents. Edelfosine targets membranes, disturbing cellular homeostasis. Is not clear at this point how membrane alterations are communicated between intracellular compartments leading to growth inhibition and eventual cell death. In the present study, a combined metabolomics/lipidomics approach for the unbiased identification of metabolic pathways altered in yeast treated with sublethal concentrations of the LysoPC analogue was employed. Mass spectrometry of polar metabolites, fatty acids, and lipidomic profiling was used to study the effects of edelfosine on yeast metabolism. Amino acid and sugar metabolism, the Krebs cycle, and fatty acid profiles were most disrupted, with polar metabolites and short-medium chain fatty acid changes preceding long and very long-chain fatty acid variations. Initial increases in metabolites such as trehalose, proline, and γ-amino butyric acid with a concomitant decrease in metabolites of the Krebs cycle, citrate and fumarate, are interpreted as a cellular attempt to offset oxidative stress in response to mitochondrial dysfunction induced by the treatment. Notably, alanine, inositol, and myristoleic acid showed a steady increase during the period analyzed (2, 4, and 6 h after treatment). Of importance was the finding that edelfosine induced significant alterations in neutral glycerolipid metabolism resulting in a significant increase in the signaling lipid diacylglycerol.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,046
Tête enseignante GPT0,369
Écart entre enseignants0,323 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations8
Publié2017
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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