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Enregistrement W2752111628 · doi:10.1093/ofid/ofx163.1562

Clinical Impact of Rapid Identification (ID) and Phenotypic Antimicrobial Susceptibility Testing (AST) by Accelerate Pheno™ System (AXDX) for Gram-negative (GNB) Bloodstream Infections

2017· article· en· W2752111628 sur OpenAlexaff
Nancy Matic, Barbara Willey, Bryan Gascon, Samantha Lee, Vita Koren, Salman Surangiwala, Pauline Lo, Tony Mazzulli, Susan M. Poutanen

Notice bibliographique

RevueOpen Forum Infectious Diseases · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueBacterial Identification and Susceptibility Testing
Établissements canadiensSinai Health SystemUniversity Health NetworkUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésABX testMedicineGram stainingAntibioticsBlood cultureAntimicrobialMicrobiologyBacilliGramBacteriaBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Laboratory turn-around-times (TATs) for identification (ID) and antimicrobial susceptibilities (AST) can delay prescription of adequate and/or optimal antimicrobial (ABX) therapy in septic patients leading to poor outcomes. The Accelerate Pheno™ system (Accelerate Diagnostics, USA) (AXDX) is a rapid ID and AST system with potential to improve TATs. Changes in Antibiotics Ordered for Gram-negative Bacilli Bloodstream Infections following Gram, ID, and AST Results. Time to Actual and Potential Antibiotic Tailoring Varying by ID and AST Method. 70 prospective non-duplicate blood cultures with Gram-negative bacilli were loaded onto AXDX. AXDX TATs were compared with TATs associated with current methods [ID by MALDI-TOF Vitek® MS (bioMérieux) using short-incubation plates, AST by Vitek® 2 (bioMérieux)]; modified current methods (calling MALDI ID and Vitek® 2 AST and releasing Vitek® 2 AST prior to purity plate review); and former methods (ID and AST by Vitek® 2), the latter determined by laboratory data review of 134 blood cultures from 2011. Impact of the change in TAT on ABX use was determined by chart review. Gram stain, ID and AST results led to tailoring of ABX in 88.6% of patients impacting 22.9%, 31.4%, and 64.3% of patients at 2.5h, 19.0h, and 62.1h respectively post positive blood culture using current methods (Figures 1 and 2). AXDX generated the shortest ID and AST TATs with the potential to shorten the time to ABX tailoring due to ID and AST to 1.3h and 6.7h respectively. Calling ID and AST results directly to physicians or releasing AST results from Vitek® 2 prior to purity plate review would also have the potential to significantly improve time to ABX change compared with current methods. Among the methods compared, AXDX has the greatest potential impact on time to appropriate antibiotics following reports of ID and AST results in Gram-negative bacilli bloodstream infections. Calling ID or AST results directly to physicians could also improve time to ABX tailoring. Impact of engaging antimicrobial stewardship teams requires further study. S. M. Poutanen, Accelerate Diagnostics: Research Contractor and Scientific Advisor, Consulting fee and Research support

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,003
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,223
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,003
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,033
Tête enseignante GPT0,351
Écart entre enseignants0,318 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2017
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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