Frequency of <i>MYD88</i> and <i>CD79B</i> mutations, and <i>MGMT</i> methylation in primary central nervous system diffuse large <scp>B</scp>‐cell lymphoma
Notice bibliographique
Résumé
Primary CNS diffuse large B-cell lymphoma (PCNS-DLBCL) and systemic DLBCL harbor mutations in MYD88 and CD79B. DNA methyltransferase (MGMT) is methylated in some DLBCL. Our goal was to investigate the frequencies of these events, which have not been previously reported within the same series of patients with PCNS-DLBCL. Fifty-four cases of PCNS-DLBCL from two institutions were analyzed by Sanger sequencing for MYD88 and CD79B, and pyrosequencing for MGMT. MYD88 mutations were identified in 68.8% (35 of 51 cases), with L265P being the most frequent mutation. Mutations other than L265P were identified in 21.6% of cases, of which eight novel MYD88 mutations were identified. Of mutated cases, 17.6% had homozygous/hemizygous MYD88 mutations, which has not been previously reported in PCNS-DLBCL. CD79B mutations were found in six of 19 cases (31.6%), all in the Y196 mutation hotspot. MGMT methylation was observed in 37% (20 of 54 cases). There was no significant difference in median overall survival (OS) between the wild type and mutated MYD88 cases, or between methylated and unmethylated MGMT cases. However, a significant difference (P = 0.028) was noted in median OS between the wild type and mutated CD79B cases.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».