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Enregistrement W2753546305 · doi:10.1101/142539

HIV disrupts CD34 <sup>+</sup> progenitors involved in T-cell differentiation

2017· preprint· en· W2753546305 sur OpenAlexfundno aff
Tetsuo Tsukamoto

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2017
Typepreprint
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueHIV Research and Treatment
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesInstitute of Infection and ImmunityMedical Research CouncilCenter for AIDS Research, University of WashingtonUniversity of New South WalesMinistry of Education, Culture, Sports, Science and TechnologyNational Health and Medical Research CouncilJapan Agency for Medical Research and Development
Mots-clésHaematopoiesisCD34Progenitor cellBiologyStem cellCXCR4Cell biologyImmunologyT cellVirologyImmune systemChemokine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract HIV-1 causes the loss of CD4 + T cells via depletion or impairment of their production. The latter involves infection of thymocytes, but the involvement of other cells including haematopoietic CD34 + cells remains unclear even though HIV-positive patients frequently manifest myelosuppression. This study utilised the OP9-DL1 coculture system, which supports in vitro T-lineage differentiation of human haematopoietic stem/progenitor cells. Cord-derived CD34 + cells were infected with CXCR4-tropic HIV-1 NL4-3 and cocultured. HIV-infected cocultures exhibited sustained viral replication for 5 weeks, as well as reduced CD4 + T-cell growth at weeks 3–5. It was further revealed that CD34 + CD7 + CXCR4 + cells can be quickly depleted as early as in 1 week after infection of the subset, and this was accompanied by the emergence of CD34 + CD7 + CD4 + cells. These results indicate that CXCR4-tropic HIV-1 strains may disrupt CD34 + CD7 + lymphoid progenitor cell pools, presumably leading to impaired T-cell production potential.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,008

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,017
Tête enseignante GPT0,238
Écart entre enseignants0,221 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2017
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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