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Enregistrement W2754201955 · doi:10.1080/07060661.2017.1378726

Pathogenic and genetic variability of<i>Fusarium verticillioides</i>from maize in northern Mexico

2017· article· en· W2754201955 sur OpenAlexvenueno aff
Karla Yeriana Leyva‐Madrigal, Eduardo Sandoval‐Castro, Carlos Calderón‐Vázquez, Claudia Patricia Larralde‐Corona, Ignacio E. Maldonado‐Mendoza

Notice bibliographique

RevueCanadian Journal of Plant Pathology · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueMycotoxins in Agriculture and Food
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesSecretaría de Investigación y Posgrado, Instituto Politécnico NacionalInstituto Politécnico Nacional
Mots-clésBiologyGenetic diversityFusariumPopulationFungusPathogenPathogenic fungusGene flowMyceliumVirulenceAsexual reproductionSexual reproductionGenetic variationGenetic variabilityBotanyGeneticsGeneGenotype

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The filamentous fungus Fusarium verticillioides is a widely distributed pathogen that causes ear, stalk and root rot of maize. This fungus also produces mycotoxins that accumulate in maize kernels. As chemical control has proven to be insufficient, new and effective disease control measures must be implemented. An improved understanding of the diversity of pathogen populations is thus crucial. Here, a set of 83 F. verticillioides isolates from a major maize-growing region of Mexico was characterized at the pathogenic and genetic diversity levels. A pathogenicity assay on maize seedlings established that all isolates were pathogenic and variable for aggressiveness, with most causing major damage on maize roots (>50% of root rotted). Genetic analysis also revealed high levels of variability, as seen by the high number of haplotypes (76), the population diversity value according to effective number of alleles (6.32), gene diversity (0.80), the polymorphic index content (0.78) and Shannon’s information index (2.06). The analysed F. verticillioides population reproduces asexually, suggesting that the observed genetic and pathogenic diversity is not the result of sexual reproduction and is probably mediated by other evolutionary forces, such as mutation, gene flow, selection and hyphal anastomosis.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,043
Score d'incertitude au seuil0,086

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,185
Écart entre enseignants0,173 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations9
Publié2017
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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