Environmental <scp>DNA</scp> metabarcoding: Transforming how we survey animal and plant communities
Pourquoi ce travail est-il dans la base ?
Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.
Scores machine (provisoires)
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
- Écart entre enseignants
- 0,192 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
- Statut de validation
score_only:v0-immature-baseline· tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle
Résumé
The genomic revolution has fundamentally changed how we survey biodiversity on earth. High-throughput sequencing ("HTS") platforms now enable the rapid sequencing of DNA from diverse kinds of environmental samples (termed "environmental DNA" or "eDNA"). Coupling HTS with our ability to associate sequences from eDNA with a taxonomic name is called "eDNA metabarcoding" and offers a powerful molecular tool capable of noninvasively surveying species richness from many ecosystems. Here, we review the use of eDNA metabarcoding for surveying animal and plant richness, and the challenges in using eDNA approaches to estimate relative abundance. We highlight eDNA applications in freshwater, marine and terrestrial environments, and in this broad context, we distill what is known about the ability of different eDNA sample types to approximate richness in space and across time. We provide guiding questions for study design and discuss the eDNA metabarcoding workflow with a focus on primers and library preparation methods. We additionally discuss important criteria for consideration of bioinformatic filtering of data sets, with recommendations for increasing transparency. Finally, looking to the future, we discuss emerging applications of eDNA metabarcoding in ecology, conservation, invasion biology, biomonitoring, and how eDNA metabarcoding can empower citizen science and biodiversity education.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
La notice
- Revue
- Molecular Ecology
- Thématique
- Environmental DNA in Biodiversity Studies
- Domaine
- Environmental Science
- Établissements canadiens
- Université Laval
- Organismes subventionnaires
- European Social FundCenter for Sponsored Coastal Ocean ResearchNatural Environment Research CouncilNational Science FoundationStrategic Environmental Research and Development ProgramNERC Biomolecular Analysis FacilitySchweizerischer Nationalfonds zur Förderung der Wissenschaftlichen ForschungBangor UniversitySight Research UKNational Oceanic and Atmospheric AdministrationEuropean Cooperation in Science and TechnologyLlywodraeth CymruU.S. Department of DefenseEcological Society of America
- Mots-clés
- BiologyEnvironmental DNAMolecular ecologyDNAEvolutionary biologyEcologyComputational biologyGeneticsBiodiversityPopulation
- Résumé présent dans OpenAlex
- oui