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Enregistrement W2757101956 · doi:10.1186/s13073-017-0476-3

Creating a data resource: what will it take to build a medical information commons?

2017· article· en· W2757101956 sur OpenAlexaff
Patricia A. Deverka, Mary A. Majumder, Angela G. Villanueva, Margaret Anderson, Annette Bakker, Jessica Bardill, Eric Boerwinkle, Tania Bubela, Barbara J. Evans, Nanibaa’ A. Garrison, Richard A. Gibbs, Robert Gentleman, David Glazer, Melissa M. Goldstein, Hank Greely, Crane Harris, Bartha Maria Knoppers, Barbara A. Koenig, Isaac S. Kohane, Salvatore La Rosa, John Mattison, Christopher J. O’Donnell, Heidi L. Rehm, Laura Lyman Rodriguez, Robert Shelton, Tania Simoncelli, Sharon F. Terry, Michael S. Watson, John Wilbanks, Robert Cook‐Deegan, Amy L. McGuire

Notice bibliographique

RevueGenome Medicine · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueEthics in Clinical Research
Établissements canadiensMcGill UniversitySimon Fraser UniversityConcordia University
Organismes subventionnairesNational Human Genome Research InstituteNational Institutes of Health
Mots-clésData sharingCommonsGovernment (linguistics)Open dataKnowledge managementStakeholderBusinessBig dataResource (disambiguation)Public relationsComputer sciencePolitical scienceMedicineWorld Wide Web

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

National and international public-private partnerships, consortia, and government initiatives are underway to collect and share genomic, personal, and healthcare data on a massive scale. Ideally, these efforts will contribute to the creation of a medical information commons (MIC), a comprehensive data resource that is widely available for both research and clinical uses. Stakeholder participation is essential in clarifying goals, deepening understanding of areas of complexity, and addressing long-standing policy concerns such as privacy and security and data ownership. This article describes eight core principles proposed by a diverse group of expert stakeholders to guide the formation of a successful, sustainable MIC. These principles promote formation of an ethically sound, inclusive, participant-centric MIC and provide a framework for advancing the policy response to data-sharing opportunities and challenges.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,232
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,196
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMétarecherche, Communication savante, Science ouverte
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Théorique ou conceptuel · Signal consensuel: Théorique ou conceptuel
GenreSignal candidat: Commentaire · Signal consensuel: Commentaire
Score de désaccord entre enseignants0,993
Score d'incertitude au seuil0,947

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,2320,196
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,002
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,002
Bibliométrie0,0050,004
Études des sciences et des technologies0,0190,062
Communication savante0,0520,109
Science ouverte0,0070,049
Intégrité de la recherche0,0250,022
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0090,005

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,480
Tête enseignante GPT0,575
Écart entre enseignants0,095 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Devis d'étudeThéorique ou conceptuel
Domainenon disponible
GenreCommentaire

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations44
Publié2017
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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