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Enregistrement W2758972505 · doi:10.1200/jco.2017.35.15_suppl.e13114

Prognostic implication of GATA3 gene mutation on survival in invasive ductal carcinoma of the breast.

2017· article· en· W2758972505 sur OpenAlexaboutno aff
Karthik Kailasam, Mohammad Omaira, Hardik Satish Chhatrala, Marie Ravichandar

Notice bibliographique

RevueJournal of Clinical Oncology · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCancer Diagnosis and Treatment
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMedicineGATA3Breast cancerEstrogen receptorOncologyInternal medicineDuctal carcinomaCarcinomaCancerMale breast cancerPathologyGeneBiologyTranscription factorGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

e13114 Background: GATA3 encodes a transcription factor, which is involved in activation and suppression of genes involved in cell maturation. GATA3 is necessary in the adult mammary gland to maintain the integrity and function of the luminal epithelium. Methods: METABRIC project funded by cancer research UK, the British Columbia cancer foundation and the Canadian breast cancer foundation mapped 173 gene mutations and amplifications in 2,433 primary breast tumors. Retrospective analysis was done for patients with invasive ductal carcinoma of the breast in the age group 30-60; to study the effect of GATA3 mutation on survival. Median survival was obtained from Kaplan-Meier plot, and mortality between groups was compared by Odds ratio (OR). Results: A total of 1500 patients across all age groups had invasive ductal carcinoma. 650 were within the age group 30-60; of which 234 died due to the disease, 360 were alive and 55 died due to other causes. 398 patients (61.2%) tested positive for estrogen receptor (ER) and 521 patients (80.2%) were negative for HER2 (human epidermal growth factor receptor 2). TP53 (50%) and PIK3CA (36%) mutations were more prevalent. GATA3 mutation was found in 79 patients (12.34%); among which, all 79 patients tested positive for ER (100%) and 74 patients (94.9%) negative for HER2. 10 patients (12.7%) died due to the disease, 62 patients (78.5%) were alive and 7 patients (8.9%) died due to other causes. Hence, patients with GATA3 mutations were more likely to survive (OR 4.66; CI 2.33-9.29 p < 0.0001) than patients without the mutation. The median survival for patients with GATA3 mutation (300 months) was also greater than patients without the mutation (219 months). In addition, patients with GATA3 mutation were more likely to be ER positive and HER2 negative. Conclusions: In the mammary gland, GATA3 is required for luminal epithelial cell differentiation. Loss of GATA3 results in de-differentiation to stem cell phenotype. It is found that GATA3 mutation correlates with a better prognosis compared to more common TP53 and PIK3CA gene mutations.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,003
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,031
Score d'incertitude au seuil0,396

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,003
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,135
Tête enseignante GPT0,467
Écart entre enseignants0,332 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2017
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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