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Enregistrement W2760088629

Nouvelle approche zymographique pour déterminer l'activité intrinsèque de la diamine oxydase en présence de la catalase dans des formulations bi-enzymatiques

2017· article· fr· W2760088629 sur OpenAlexfundno aff
Samaneh Ahmadifar

Notice bibliographique

RevueArchipelago (Université du Québec à Montréal) · 2017
Typearticle
Languefr
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePolyamine Metabolism and Applications
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaCourtois FoundationRegione Lazio
Mots-clésChemistryMolecular biologyBiology
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

La diamine oxydase (DAO, EC 1.4.3.22) est une enzyme à cuivre présente dans les règnes animal et végétal. Elle est impliquée surtout dans le processus de dégradation des amines biogènes dont l'histamine. Un déséquilibre entre la production et la dégradation de l'histamine peut causer des effets indésirables tels que des réactions allergiques, des dysfonctionnements gastro-intestinaux, notamment dans le cas des maladies inflammatoires de l'intestin (i.e. maladie de Crohn). La DAO d'origine végétale a été proposée comme un agent antihistaminique naturel administré par voie orale. Afin de protéger la DAO face à la dégradation par des protéases pancréatiques durant le transit intestinal, elle a été immobilisée dans des microbilles à base d'alginate et de carboxyméthyl amidon (CMA) obtenues par gélification ionotropique avec l'ion Ca2+. La DAO, en catalysant l'oxydation de l'histamine en imidazole-acétaldéhyde, génère également du peroxyde d'hydrogène qui est toxique. Pour neutraliser ses effets néfastes, la catalase a été ajoutée dans la formulation de DAO. Dans ce projet de Maîtrise, les objectifs principaux étaient : i) déterminer la DAO en présence de la catalase (enzyme hautement interférente dans le dosage de la DAO à cause de la décomposition du H2O2; ii) réaliser l'inclusion de la DAO dans des microsphères à base de carboxyméthyl amidon et alginate; iii) évaluer la stabilité de la DAO dans des microsphères suite à l'incubation en conditions simulant le tractus intestinal; iv) déterminer l'activité spécifique intrinsèque de la DAO en présence des enzymes interférentes comme la catalase ou dénaturantes comme des protéases pancréatique. Il est important de mentionner que l'ajout de la catalase dans la formulation DAO ne permet donc pas de mesurer l'activité de DAO par les méthodes usuelles via le dosage de peroxyde d'hydrogène. Dans ce contexte, l'élaboration d'une nouvelle méthode pour déterminer l'activité de la DAO en présence d'autres protéines bioactives a constitué le point central du projet. Ainsi une nouvelle méthode basée sur la zymographie a été élaborée. La DAO et la glucose oxydase ont été soumis à la zymographie dans des conditions dénaturantes (en présence de SDS), mais non réductrices (en absence de β-mercaptoéthanol). La DAO et des protéines contaminantes (catalase et protéase) ont été séparées par électrophorèse sur gel polyacrylamide (PAA) contenant la peroxydase. Suite à l'électrophorèse, le gel a été incubé dans une solution de révélation composée de putrescine (substrat de la DAO) et d'ortho-phénylènediamine (o-PDA, co-substrat de la peroxydase). Afin de calculer l'activité spécifique intrinsèque, une courbe standard a été établie avec des quantités connues de DAO. Les résultats ont aussi montré que les microbilles à base d'alginate/CMA génèrent une bonne protection des enzymes face à la dégradation des protéases pancréatiques. Cette nouvelle approche est une des premières méthodes permettant de déterminer l'activité spécifique intrinsèque de la DAO en présence d'autres enzymes et de protéines interférentes.
\n______________________________________________________________________________ 
\nMOTS-CLÉS DE L’AUTEUR : Diamine oxydase, Catalase, Microbilles à base d'Alginate et de Carboxyméthyl amidon, Détermination de l'activité spécifique intrinsèque par zymographie.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,567
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0010,002
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,005
Tête enseignante GPT0,220
Écart entre enseignants0,215 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2017
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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