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Record W2760088629

Nouvelle approche zymographique pour déterminer l'activité intrinsèque de la diamine oxydase en présence de la catalase dans des formulations bi-enzymatiques

2017· article· fr· W2760088629 on OpenAlexfundno aff
Samaneh Ahmadifar

Bibliographic record

VenueArchipelago (Université du Québec à Montréal) · 2017
Typearticle
Languagefr
FieldBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
TopicPolyamine Metabolism and Applications
Canadian institutionsnot available
FundersNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaCourtois FoundationRegione Lazio
KeywordsChemistryMolecular biologyBiology
DOInot available

Abstract

fetched live from OpenAlex

La diamine oxydase (DAO, EC 1.4.3.22) est une enzyme à cuivre présente dans les règnes animal et végétal. Elle est impliquée surtout dans le processus de dégradation des amines biogènes dont l'histamine. Un déséquilibre entre la production et la dégradation de l'histamine peut causer des effets indésirables tels que des réactions allergiques, des dysfonctionnements gastro-intestinaux, notamment dans le cas des maladies inflammatoires de l'intestin (i.e. maladie de Crohn). La DAO d'origine végétale a été proposée comme un agent antihistaminique naturel administré par voie orale. Afin de protéger la DAO face à la dégradation par des protéases pancréatiques durant le transit intestinal, elle a été immobilisée dans des microbilles à base d'alginate et de carboxyméthyl amidon (CMA) obtenues par gélification ionotropique avec l'ion Ca2+. La DAO, en catalysant l'oxydation de l'histamine en imidazole-acétaldéhyde, génère également du peroxyde d'hydrogène qui est toxique. Pour neutraliser ses effets néfastes, la catalase a été ajoutée dans la formulation de DAO. Dans ce projet de Maîtrise, les objectifs principaux étaient : i) déterminer la DAO en présence de la catalase (enzyme hautement interférente dans le dosage de la DAO à cause de la décomposition du H2O2; ii) réaliser l'inclusion de la DAO dans des microsphères à base de carboxyméthyl amidon et alginate; iii) évaluer la stabilité de la DAO dans des microsphères suite à l'incubation en conditions simulant le tractus intestinal; iv) déterminer l'activité spécifique intrinsèque de la DAO en présence des enzymes interférentes comme la catalase ou dénaturantes comme des protéases pancréatique. Il est important de mentionner que l'ajout de la catalase dans la formulation DAO ne permet donc pas de mesurer l'activité de DAO par les méthodes usuelles via le dosage de peroxyde d'hydrogène. Dans ce contexte, l'élaboration d'une nouvelle méthode pour déterminer l'activité de la DAO en présence d'autres protéines bioactives a constitué le point central du projet. Ainsi une nouvelle méthode basée sur la zymographie a été élaborée. La DAO et la glucose oxydase ont été soumis à la zymographie dans des conditions dénaturantes (en présence de SDS), mais non réductrices (en absence de β-mercaptoéthanol). La DAO et des protéines contaminantes (catalase et protéase) ont été séparées par électrophorèse sur gel polyacrylamide (PAA) contenant la peroxydase. Suite à l'électrophorèse, le gel a été incubé dans une solution de révélation composée de putrescine (substrat de la DAO) et d'ortho-phénylènediamine (o-PDA, co-substrat de la peroxydase). Afin de calculer l'activité spécifique intrinsèque, une courbe standard a été établie avec des quantités connues de DAO. Les résultats ont aussi montré que les microbilles à base d'alginate/CMA génèrent une bonne protection des enzymes face à la dégradation des protéases pancréatiques. Cette nouvelle approche est une des premières méthodes permettant de déterminer l'activité spécifique intrinsèque de la DAO en présence d'autres enzymes et de protéines interférentes.
\n______________________________________________________________________________ 
\nMOTS-CLÉS DE L’AUTEUR : Diamine oxydase, Catalase, Microbilles à base d'Alginate et de Carboxyméthyl amidon, Détermination de l'activité spécifique intrinsèque par zymographie.

Fetched live from OpenAlex and de-inverted. Abstracts are not stored in this database: the inverted indexes are 8.6 GB of the frame’s 9.3 GB of text, and the host has 13 GB free.

How this classification was reachedexpand

Full frame distilled prediction

Teacher imitation

Not calibrated prevalence, not ground truth. Human validation pending. Learned from the 10,348 direct Codex labels and 10,348 direct Gemma labels. Candidate is the union of thresholded teacher heads; consensus is their intersection. These outputs are machine_predicted_unvalidated and are not human labels or direct frontier model labels.

metaresearch head score (Codex)0.000
metaresearch head score (Gemma)0.001
Version: codex-gemma-dda1882f352aValidation status: machine_predicted_unvalidated
Candidate categoriesMeta-epidemiology (narrow)
Consensus categoriesnone
DomainCandidate signal: none · Consensus signal: none
Study designCandidate signal: Bench or experimental · Consensus signal: none
GenreCandidate signal: Empirical · Consensus signal: Empirical
Teacher disagreement score0.567
Threshold uncertainty score1.000

Codex and Gemma teacher scores by category

CategoryCodexGemma
Metaresearch0.0000.001
Meta-epidemiology (narrow)0.0000.000
Meta-epidemiology (broad)0.0000.000
Bibliometrics0.0000.000
Science and technology studies0.0010.002
Scholarly communication0.0000.000
Open science0.0010.001
Research integrity0.0000.000
Insufficient payload (model declined to judge)0.0000.000

Machine scores (provisional)

The two teacher heads of the student model, read on this work. A score orders the frame for review; it never asserts a category, and the validation status ships verbatim with every row.

Baseline scores from an immature model (maturity gate not passed, 7 training rounds). Scores rank; they never assert a category.

Opus teacher head0.005
GPT teacher head0.220
Teacher spread0.215 · how far apart the two teachers sit on this one work
Validation statusscore_only:v0-immature-baseline · verbatim from the scoring run: score_only means the number may rank works, and no category label ships from it

Classification

machine, unvalidated

Machine predicted; a candidate call from one teacher head, not a consensus.

Study designBench or experimental
Domainnot available
GenreEmpirical

How this classification was reached, model by model and score by score, is at the end of the page under "How this classification was reached".

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Citations0
Published2017
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