Globalizing Genomics: The Origins of the International Nucleotide Sequence Database Collaboration
Notice bibliographique
Résumé
Genomics is increasingly considered a global enterprise - the fact that biological information can flow rapidly around the planet is taken to be important to what genomics is and what it can achieve. However, the large-scale international circulation of nucleotide sequence information did not begin with the Human Genome Project. Efforts to formalize and institutionalize the circulation of sequence information emerged concurrently with the development of centralized facilities for collecting that information. That is, the very first databases build for collecting and sharing DNA sequence information were, from their outset, international collaborative enterprises. This paper describes the origins of the International Nucleotide Sequence Database Collaboration between GenBank in the United States, the European Molecular Biology Laboratory Databank, and the DNA Database of Japan. The technical and social groundwork for the international exchange of nucleotide sequences created the conditions of possibility for imagining nucleotide sequences (and subsequently genomes) as a "global" objects. The "transnationalism" of nucleotide sequence was critical to their ontology - what DNA sequences came to be during the Human Genome Project was deeply influenced by international exchange.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,020 | 0,015 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,004 | 0,006 |
| Études des sciences et des technologies | 0,006 | 0,019 |
| Communication savante | 0,015 | 0,018 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,010 |
| Intégrité de la recherche | 0,003 | 0,005 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».