Impact of deletion of a catabolite repressor Mig1 on hyphal morphology and cellulase expression in Penicillium funiculosum NCIM1228
Notice bibliographique
Résumé
Carbon catabolite repression (CCR) is a regulatory mechanism which negatively regulates genes of for ancillary carbon source utilization. It is mediated by Mig1 orthologues, which are Zn finger transcriptional repressors. We studied the effect of CCR disruption in Penicillium funiculosum NCIM1228, a hypercelluloytic ascomycete. Upon phylogenetic analysis of fungal genomes, Mig1 presence across all taxa of kingdom fungi revealed its conserved role in catabolite repression. Also it was found to constitute distinct clade from industrially important cellulase producing fungi like Trichoderma reesei and Aspergillus sp. It shared the clade with other highly evolved fungi T. cellulolyticus and P. marneffei and represented more recent radiations of evolutionary conserved catabolite repressor Mig1. Genotypic analysis showed that NCIM1228 harbors a truncated yet functional allele of Mig1. Mig1 orthologue of NCIM1228 has a non-sense mutation at 134th amino acid position, making a large C-terminal portion of Mig1 (415aa) dispensable for carbon repression. NCIM1228 was grown in presence of allyl alcohol to check the phenotypic effect. NCIM1228 showed sensitivity to allyl alcohol as compared to Penicillium funiculosum (Pf). Deleting active Zn finger domain made NCIM1228 completely sensitive to allyl alcohol. Surprisingly, the deletion showed small and compact colonies with compromised filamentous proliferation while the dry mycelial weight didn’t change when grown on 0.5% glucose supplemented with 2% avicel. Using microscopy, we unraveled that PfΔMig1 showed reduced aerial hyphae and profuse branching pattern in terminal hyphae resulting in compact colonies. We further observed more than two-fold (7.6 FPU/ml) higher FPU in production media than NCIM1228 under similar condition.
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Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
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score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».