Response of Populus deltoides Bartr. ex Marsh genes under elevated CO2 through Next-Generation Sequencing (NGS)
Pourquoi ce travail est dans la base
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Notice bibliographique
Résumé
The impact of climate change has attracted considerable attention globally. Atmospheric Carbon Dioxide (CO2) is expected to increase to 900 μmol mol-1 from present level of 400 μmol mol-1 by the end of 21st century. CO2 is a greenhouse gas that leads climate change have significantly affected structure and function of the terrestrial ecosystem, global carbon, water balance, and also crop productivity. These responses of the plant appear by altering gene expression pattern of different genes involved in anabolic and catabolic processes. We have conducted a study to see the response of genes to elevated CO2 inside open top chambers on Populus deltoides. Onemonth- old ramets were exposed for 180 days to treatment (CO2 800 μmol mol-1) and control (CO2 ~400 μmol mol-1). After completion of treatment, leaf tissues were outsourced to Sci-genome for transcriptome sequencing. This study demonstrated, higher (1754) number of transcript expression in treatment (119,306) compared to control (121,060). Differential gene expression analysis shown 1951 transcripts were down regulated while 2603 transcripts up regulated and 159,982 transcripts have no significance in treatment. Our results show that plants growing in an environment where atmospheric CO2 is higher may alter plant adaptation, productivity, vegetation and ecosystem health by changing; the first, number of genes and second, altering gene expression patterns. Such behavior may be a good indicator of developing adaptation strategies of the plant.
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Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle