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Enregistrement W2762533155

Abstract #1513: Recruitment of histone acetyltransferase activity by the N-terminal homology domain of Pygopus augments TCF-dependent transcriptional activation

2009· article· en· W2762533155 sur OpenAlexaff
Phillip Andrews, Kenneth R. Kao, Catherine Popadiuk

Notice bibliographique

RevueCancer Research · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCancer-related gene regulation
Établissements canadiensMemorial University of Newfoundland
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésHistone acetyltransferaseCREB-binding proteinBiologyAcetyltransferaseEnhancerHistoneMolecular biologyChromatin immunoprecipitationTranscription (linguistics)Cell biologyTranscription factorPromoterGeneCREBGeneticsGene expressionAcetylation
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Pygopus is a core component of the beta-catenin/TCF transcriptional activation complex, hypothesized to augment target gene expression by interpreting and modifying the local histone code. Pygopus is essential for development of the early embryo for both Wnt-dependent and Wnt-independent activity and is also required for breast and epithelial ovarian cancer cell growth. The Pygopus protein consists of two conserved domains: a plant homeo domain (PHD), which interacts with the Legless (lgs) adapter protein linking it to the beta-catenin/TCF complex, and an N-terminal homology domain (NHD). The NHD is essential for transcriptional activity, but evidence is lacking on its interaction with other proteins. We now demonstrate that the interaction of Pygopus with histone acetyltransferase (HAT) family members via specific residues in its N-terminal homology domain (NHD) is required to enhance beta-catenin/TCF mediated transcription. The HAT family member CREB Binding Protein (CBP), a component of the beta-catenin/TCF complex, augmented Pygopus-mediated transcription from both TCF/LEF-specific reporter genes, as well as from DNA-tethered Pygopus. Furthermore, immunoprecipitated Pygopus protein complexes displayed CBP-dependent histone acetyltransferase activity. Our data support a model in which the chromatin relaxation requirement in TCF/beta-catenin-mediated transcriptional activation is fulfilled by recruitment of the histone acetyltransferase CBP by Pygopus. Citation Information: In: Proc Am Assoc Cancer Res; 2009 Apr 18-22; Denver, CO. Philadelphia (PA): AACR; 2009. Abstract nr 1513.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,008
Score d'incertitude au seuil0,028

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0080,002

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,069
Tête enseignante GPT0,417
Écart entre enseignants0,348 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2009
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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