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Enregistrement W2762800551 · doi:10.4039/tce.2017.49

Contribution of DNA barcoding to the study of the bees (Hymenoptera: Apoidea) of Canada: progress to date

2017· article· en· W2762800551 sur OpenAlexafffundabout
Cory S. Sheffield, Jennifer Heron, Jason Gibbs, Thomas M. Onuferko, Ryan Oram, Lincoln R. Best, Nicholai deSilva, Sheila Dumesh, Alana Pindar, Genevieve Lauren Rowe

Notice bibliographique

RevueThe Canadian Entomologist · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant and animal studies
Établissements canadiensUniversity of GuelphYork UniversityUniversity of CalgaryRoyal Saskatchewan MuseumUniversity of ReginaUniversity of ManitobaMinistry of Environment
Organismes subventionnairesYork UniversityMinistry of EnvironmentGenome CanadaOntario GenomicsNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaMinistry of Agriculture - SaskatchewanOntario Genomics Institute
Mots-clésHalictidaeDNA barcodingBiologyApoideaMegachilidaeHymenopteraTaxonZoologyEcologyApidaeGenusSpecies complexPollinationPollenPollinator

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Bees (Hymenoptera: Apoidea, Apiformes) are taxonomically and ecologically diverse, with a wide range of social complexity, nesting preferences, floral associations, and biogeographic restrictions. A Canadian bee checklist, greatly assisted by the gene-assisted approach of DNA barcoding, is nearing completion. Previous evaluation of bee diversity in Canada, assisted by DNA barcoding, was restricted to Nova Scotia, which contains about 25% of the bee species in the country. Here, we summarise efforts to date to build a comprehensive DNA barcode library supporting bee taxonomic studies in Canada, consisting of more than 12 500 barcode-compliant sequences yielding 811 distinct barcode index numbers (BINs). This appears to represent ~95% of the 856 bee species presently recorded from Canada, but comparison with known morphological species in each genus shows that some genera are still under-sampled or may contain cryptic taxa, with much taxonomic work still to be done on bees in Canada. This is particularly true within the taxonomically difficult genera Andrena Fabricius (Andrenidae) , Hylaeus Fabricius (Colletidae), Melissodes Latreille (Apidae), Nomada Scopoli (Apidae), Osmia Panzer (Megachilidae), and Sphecodes Latreille (Halictidae). DNA analysis will likely be a key asset in resolving bee taxonomic issues in Canada in the future, and to date has even assisted studies of well-known bee taxa. Here we present summaries of our results, and discuss the use of DNA barcoding to assist future taxonomic work, faunal lists, and ecological studies.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,088
Score d'incertitude au seuil0,711

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,047
Tête enseignante GPT0,241
Écart entre enseignants0,194 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations46
Publié2017
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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