Contribution of DNA barcoding to the study of the bees (Hymenoptera: Apoidea) of Canada: progress to date
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Bees (Hymenoptera: Apoidea, Apiformes) are taxonomically and ecologically diverse, with a wide range of social complexity, nesting preferences, floral associations, and biogeographic restrictions. A Canadian bee checklist, greatly assisted by the gene-assisted approach of DNA barcoding, is nearing completion. Previous evaluation of bee diversity in Canada, assisted by DNA barcoding, was restricted to Nova Scotia, which contains about 25% of the bee species in the country. Here, we summarise efforts to date to build a comprehensive DNA barcode library supporting bee taxonomic studies in Canada, consisting of more than 12 500 barcode-compliant sequences yielding 811 distinct barcode index numbers (BINs). This appears to represent ~95% of the 856 bee species presently recorded from Canada, but comparison with known morphological species in each genus shows that some genera are still under-sampled or may contain cryptic taxa, with much taxonomic work still to be done on bees in Canada. This is particularly true within the taxonomically difficult generaAndrenaFabricius (Andrenidae), HylaeusFabricius (Colletidae),MelissodesLatreille (Apidae),NomadaScopoli (Apidae),OsmiaPanzer (Megachilidae), andSphecodesLatreille (Halictidae). DNA analysis will likely be a key asset in resolving bee taxonomic issues in Canada in the future, and to date has even assisted studies of well-known bee taxa. Here we present summaries of our results, and discuss the use of DNA barcoding to assist future taxonomic work, faunal lists, and ecological studies.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,004 | 0,007 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,006 | 0,007 |
| Études des sciences et des technologies | 0,002 | 0,002 |
| Communication savante | 0,003 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,002 | 0,002 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,002 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».