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Enregistrement W2765263555 · doi:10.1016/j.biopsych.2017.10.019

Brain Regions Showing White Matter Loss in Huntington’s Disease Are Enriched for Synaptic and Metabolic Genes

2017· article· en· W2765263555 sur OpenAlexaff
Peter McColgan, Sarah Gregory, Kiran Seunarine, Adeel Razi, Marina Papoutsi, Eileanoir B. Johnson, Alexandra Dürr, Raymund A.C. Roos, Blair R. Leavitt, Peter Holmans, Rachael I. Scahill, Chris A. Clark, Geraint Rees, Sarah J. Tabrizi, Allison Coleman, Joji Decolongon, Ming Fan, Terri L. Petkau, C Jauffret, Damián Justo, Stéphane Lehéricy, K Nigaud, Romain Valabrègue, Anne Schoonderbeek, Ellen P. Hart, Davina J. Hensman Moss, Rajarshi Ghosh, Helen Crawford, C. Berna, D. Mahaleskshmi, Ralf Reilmann, N Weber, Izelle Labuschagne, Julie C. Stout, G. Bernhard Landwehrmeyer, Michael Orth, Isabella Mayer, Hans J. Johnson, D. Crawfurd

Notice bibliographique

RevueBiological Psychiatry · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueGenetic Neurodegenerative Diseases
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesUniversität UlmNED University of Engineering and TechnologyMonash UniversityInstitut National de la Santé et de la Recherche MédicaleMedical Research CouncilCardiff UniversityUniversity College London Hospitals NHS Foundation TrustRosetrees TrustCentre National de la Recherche ScientifiqueCHDI FoundationUniversity of Engineering and Technology, LahoreWellcome TrustNational Institute for Health and Care ResearchNIHR Biomedical Research Centre, Royal Marsden NHS Foundation Trust/Institute of Cancer ResearchUniversity College LondonAssistance publique-Hôpitaux de ParisUniversiteit LeidenPan-Massachusetts Challenge
Mots-clésWhite matterHuntington's diseaseNeuroscienceGeneDiseaseBiologyGeneticsMedicineInternal medicineMagnetic resonance imaging

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: The earliest white matter changes in Huntington's disease are seen before disease onset in the premanifest stage around the striatum, within the corpus callosum, and in posterior white matter tracts. While experimental evidence suggests that these changes may be related to abnormal gene transcription, we lack an understanding of the biological processes driving this regional vulnerability. METHODS: Here, we investigate the relationship between regional transcription in the healthy brain, using the Allen Institute for Brain Science transcriptome atlas, and regional white matter connectivity loss at three time points over 24 months in subjects with premanifest Huntington's disease relative to control participants. The baseline cohort included 72 premanifest Huntington's disease participants and 85 healthy control participants. RESULTS: We show that loss of corticostriatal, interhemispheric, and intrahemispheric white matter connections at baseline and over 24 months in premanifest Huntington's disease is associated with gene expression profiles enriched for synaptic genes and metabolic genes. Corticostriatal gene expression profiles are predominately associated with motor, parietal, and occipital regions, while interhemispheric expression profiles are associated with frontotemporal regions. We also show that genes with known abnormal transcription in human Huntington's disease and animal models are overrepresented in synaptic gene expression profiles, but not in metabolic gene expression profiles. CONCLUSIONS: These findings suggest a dual mechanism of white matter vulnerability in Huntington's disease, in which abnormal transcription of synaptic genes and metabolic disturbance not related to transcription may drive white matter loss.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,030
Score d'incertitude au seuil0,730

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,060
Tête enseignante GPT0,305
Écart entre enseignants0,245 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations104
Publié2017
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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