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Enregistrement W2765304775 · doi:10.1158/1078-0432.ccr-17-1621

Homologous Recombination DNA Repair Pathway Disruption and Retinoblastoma Protein Loss Are Associated with Exceptional Survival in High-Grade Serous Ovarian Cancer

2017· article· en· W2765304775 sur OpenAlexafffund
Dale W. Garsed, Kathryn Alsop, Sián Fereday, Catherine Emmanuel, Catherine J. Kennedy, Dariush Etemadmoghadam, Bo Gao, Val Gebski, Valérie Garès, Elizabeth L. Christie, Maartje C.A. Wouters, Katy Milne, Joshy George, Ann‐Marie Patch, Jason Li, Gisela Mir Arnau, Timothy Semple, Sreeja Gadipally, Yoke-Eng Chiew, Joy Hendley, Thomas Mikeska, Giada V. Zapparoli, Kaushalya Amarasinghe, Sean M. Grimmond, John V. Pearson, Nicola Waddell, Jillian A. Hung, Colin J.R. Stewart, Raghwa Sharma, Prue E. Allan, Peter Rambau, Orla McNally, Linda Mileshkin, Anne Hamilton, Sumitra Ananda, Marisa Grossi, Paul A. Cohen, Yee Leung, Robert Rome, Philip Beale, Penny Blomfield, Michael Friedländer, Alison H. Brand, Alexander Dobrovic, Martin Köbel, Paul R. Harnett, Brad H. Nelson, David D.L. Bowtell, Anna DeFazio

Notice bibliographique

RevueClinical Cancer Research · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiquePARP inhibition in cancer therapy
Établissements canadiensFoothills Medical CentreBC Cancer Agency
Organismes subventionnairesMedical Research and Materiel CommandNational Health and Medical Research CouncilCanadian Institutes of Health ResearchCancer Institute NSWCancer AustraliaNational Breast Cancer Foundation
Mots-clésHomologous recombinationSerous fluidOvarian cancerRetinoblastomaBiologyDNA repairHomologous chromosomeSerous ovarian cancerCancerCancer researchGeneticsDNAGeneBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Purpose: Women with epithelial ovarian cancer generally have a poor prognosis; however, a subset of patients has an unexpected dramatic and durable response to treatment. We sought to identify clinical, pathological, and molecular determinants of exceptional survival in women with high-grade serous cancer (HGSC), a disease associated with the majority of ovarian cancer deaths. Experimental Design: We evaluated the histories of 2,283 ovarian cancer patients and, after applying stringent clinical and pathological selection criteria, identified 96 with HGSC that represented significant outliers in terms of treatment response and overall survival. Patient samples were characterized immunohistochemically and by genome sequencing. Results: Different patterns of clinical response were seen: long progression-free survival (Long-PFS), multiple objective responses to chemotherapy (Multiple Responder), and/or greater than 10-year overall survival (Long-Term Survivors). Pathogenic germline and somatic mutations in genes involved in homologous recombination (HR) repair were enriched in all three groups relative to a population-based series. However, 29% of 10-year survivors lacked an identifiable HR pathway alteration, and tumors from these patients had increased Ki-67 staining. CD8+ tumor-infiltrating lymphocytes were more commonly present in Long-Term Survivors. RB1 loss was associated with long progression-free and overall survival. HR deficiency and RB1 loss were correlated, and co-occurrence was significantly associated with prolonged survival. Conclusions: There was diversity in the clinical trajectory of exceptional survivors associated with multiple molecular determinants of exceptional outcome in HGSC patients. Concurrent HR deficiency and RB1 loss were associated with favorable outcomes, suggesting that co-occurrence of specific mutations might mediate durable responses in such patients. Clin Cancer Res; 24(3); 569–80. ©2017 AACR. See related commentary by Peng and Mills, p. 508

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,005
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,016
Score d'incertitude au seuil0,823

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0050,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,176
Tête enseignante GPT0,474
Écart entre enseignants0,298 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations95
Publié2017
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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