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Enregistrement W2765312387 · doi:10.3389/fphys.2017.00730

Corrigendum: Candidate Gene Resequencing in a Large Bicuspid Aortic Valve-Associated Thoracic Aortic Aneurysm Cohort: SMAD6 as an Important Contributor

2017· erratum· en· W2765312387 sur OpenAlexaff
Elisabeth Gillis, Ajay Kumar, Ilse Luyckx, Christoph Preuß, Elyssa Cannaerts, Gerarda van de Beek, Björn Wieschendorf, Maaike Alaerts, Nikhita Bolar, Geert Vandeweyer, Josephina Meester, Florian Wünnemann, Russell A. Gould, Rustam Zhurayev, Zerbino Dd, Salah A. Mohamed, Seema Mital, Luc Mertens, Hanna M. Björck, Anders Franco‐Cereceda, Andrew S. McCallion, Lut Van Laer, Judith M.A. Verhagen, Ingrid M.B.H. van de Laar, Marja W. Wessels, Emmanuel Messas, Guillaume Goudot, Michaela Němčíková, Alice Krebsová, Marlies Kempers, Simone Salemink, Toon Duijnhouwer, Xavier Jeunemaı̂tre, Juliette Albuisson, Per Eriksson, Grégor Andelfinger, Harry C. Dietz, Aline Verstraeten, Bart Loeys

Notice bibliographique

RevueFrontiers in Physiology · 2017
Typeerratum
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAortic Disease and Treatment Approaches
Établissements canadiensSickKids FoundationCentre Hospitalier Universitaire Sainte-JustineUniversité de Montréal
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBicuspid aortic valveThoracic aortic aneurysmCardiologyInternal medicineMedicineAortic aneurysmCohortAneurysmCandidate geneAortic valveGeneAortaSurgeryGeneticsBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

In the original article, we noted two mutation annotation errors. The correction of these two mistakes does not change the scientific conclusions in any way. The authors apologize for these nomenclature errors. Please find below the corrected annotations of those two mutations: (1) The correct RNA and protein annotations of the SMAD6 variant in P99 are c.455_461del and p.Pro152Profs*27, and not c.454_461del and p.Gly166Valfs*23. (2) The correct RNA and protein annotations of the SMAD6 variant in P128 are c.74_79del and p.Ser27_Gly28del, and not c.73_79del and p.Gly26_Ser27del. As a consequence, a correction has been made to RESULTS, Paragraphs 5 and 6: The SMAD6 c.726del variant leads to a frameshift (p.Lys242Asnfs*300) and a predicted protein with a C-terminal extension due to loss of the intended stop codon. The c.455_461del frameshift variant (p.Pro152Profs*27) causes the introduction of a premature stop codon, most likely resulting in haploinsufficiency due to nonsense-mediated mRNA decay (NMD). Also the two nonsense variants (p.Tyr279* and p.Tyr288*) are predicted to lead to NMD. All of the missense variants cluster in the functionally important MH1 and MH2 domains (Makkar et al., 2009) (amino acids 148-275 and 331-496, respectively), which is not the case for the sole missense variant (p.Ser130Leu) found in a control individual (Figure 2). All but one (p.Arg443His) of the identified variants were absent in the ExAC control cohort (v0.3.1; Supplementary Table 2). Moreover, the missense variants in the patient cohort (7/7) are enriched in the MH1 and MH2 domains when compared to ExAC controls (n = 228/430; p = 0.02).

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,035
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Autre · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,055
Score d'incertitude au seuil0,184

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,035
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,001
Bibliométrie0,0020,001
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0020,001
Science ouverte0,0020,001
Intégrité de la recherche0,0040,004
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0550,027

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,021
Tête enseignante GPT0,304
Écart entre enseignants0,283 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreAutre

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations16
Publié2017
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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