MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2765546001 · doi:10.1139/cjb-2017-0097

The hooded mutant of <i>Lathyrus odoratus</i> (Fabaceae) is associated with a <i>cycloidea</i> gene mutation

2017· article· en· W2765546001 sur OpenAlexafffundvenue
Christine Marie Woollacott, Quentin Cronk

Notice bibliographique

RevueBotany · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePlant Reproductive Biology
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésPetalBiologyMutantLathyrusGeneticsMutationMendelian inheritanceGenePhenotypeAlleleBotany

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The hooded (hdd) floral mutant of Lathyrus odoratus L. (sweet pea) has a concave standard petal compared with the flat standard petal of the wild type. This trait was used by Bateson, Punnett, and Saunders in early studies of Mendelian inheritance (c.1905). Here we provide four lines of evidence that this phenotype results from a mutation in the CYCLOIDEA2 (CYC2) gene. (i) CYC2 is expressed in the standard petals of wild-type L. odoratus, whereas the same methods fail to detect expression in hdd plants. (ii) Genomic sequencing reveals that the CYC2 gene sequence of hdd plants is truncated at the TCP box and likely nonfunctional. (iii) In a population of 118 plants, the hdd phenotype cosegregated with the mutant allele of CYC2 without exception. (iv) CYC2 is known to act as a dorsal petal identity gene. Consistent with this, the standard petal in hdd flowers has the epidermal and pigment characteristics of wing petals, indicating that the hdd mutation results in a shift in dorsiventral petal-type identity. We conclude that the mutation in CYC2 is responsible for the hdd phenotype, and is therefore the L. odoratus equivalent of the lobed standard (lst1) mutant in Pisum.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,045
Score d'incertitude au seuil0,431

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,230
Écart entre enseignants0,221 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations7
Publié2017
Routes d'admission3
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueBotanyMême sujetPlant Reproductive BiologyTravaux en français237 207