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Enregistrement W2765558703 · doi:10.1021/acs.biochem.7b00733

Heterogeneity between Two α Subunits of α<sub>2</sub>β<sub>2</sub> Human Hemoglobin and O<sub>2</sub> Binding Properties: Raman, <sup>1</sup>H Nuclear Magnetic Resonance, and Terahertz Spectra

2017· article· en· W2765558703 sur OpenAlexaboutno aff
Shigenori Nagatomo, Kazuya Saito, Kohji Yamamoto, Takashi Ogura, Teizo Kitagawa, Masako Nagai

Notice bibliographique

RevueBiochemistry · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueHemoglobin structure and function
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesJapan Society for the Promotion of Science
Mots-clésRaman spectroscopyNuclear magnetic resonanceHemoglobinSpectral lineChemistryResonance (particle physics)Analytical Chemistry (journal)CrystallographyMaterials scienceAtomic physicsPhysicsBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Following a previous detailed investigation of the β subunit of α 2 β 2 human adult hemoglobin (Hb A), this study focuses on the α subunit by using three natural valency hybrid α(Fe 2+ -deoxy/O 2 )β(Fe 3+ ) hemoglobin M (Hb M) in which O 2 cannot bind to the β subunit: Hb M Hyde Park (β92His → Tyr), Hb M Saskatoon (β63His → Tyr), and Hb M Milwaukee (β67Val → Glu). In contrast with the β subunit that exhibited a clear correlation between O 2 affinity and Fe 2+ –His stretching frequencies, the Fe 2+ –His stretching mode of the α subunit gave two Raman bands only in the T quaternary structure. This means the presence of two tertiary structures in α subunits of the α 2 β 2 tetramer with T structure, and the two structures seemed to be nondynamical as judged from terahertz absorption spectra in the 5–30 cm –1 region of Hb M Milwaukee, α(Fe 2+ -deoxy)β(Fe 3+ ). This kind of heterogeneity of α subunits was noticed in the reported spectra of a metal hybrid Hb A like α(Fe 2+ -deoxy)β(Co 2+ ) and, therefore, seems to be universal among α subunits of Hb A. Unexpectedly, the two Fe–His frequencies were hardly changed with a large alteration of O 2 affinity by pH change, suggesting no correlation of frequency with O 2 affinity for the α subunit. Instead, a new Fe 2+ –His band corresponding to the R quaternary structure appeared at a higher frequency and was intensified as the O 2 affinity increased. The high-frequency counterpart was also observed for a partially O 2 -bound form, α(Fe 2+ -deoxy)α(Fe 2+ -O 2 )β(Fe 3+ )β(Fe 3+ ), of the present Hb M, consistent with our previous finding that binding of O 2 to one α subunit of T structure α 2 β 2 tetramer changes the other α subunit to the R structure.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,233
Écart entre enseignants0,219 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations9
Publié2017
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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