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Enregistrement W2765575792 · doi:10.1165/rcmb.2017-0237oc

Multiethnic Meta-Analysis Identifies <i>RAI1</i> as a Possible Obstructive Sleep Apnea–related Quantitative Trait Locus in Men

2017· review· en· W2765575792 sur OpenAlexafffund
Han Chen, Brian E. Cade, Kevin J. Gleason, Andrew Bjonnes, Adrienne M. Stilp, Tamar Sofer, Matthew P. Conomos, Sonia Ancoli‐Israel, Raanan Arens, Ali Azarbarzin, Graeme I. Bell, Jennifer E. Below, Sung Chun, Daniel S. Evans, Ralf Ewert, Alexis C. Wood, Sina A. Gharib, José Haba‐Rubio, Erika W. Hagen, Raphaël Heinzer, David R. Hillman, W. Craig Johnson, Zoltán Kutalik, Jacqueline M. Lane, Emma K. Larkin, Seung Ku Lee, Jingjing Liang, José S. Loredo, Sutapa Mukherjee, Lyle J. Palmer, George Papanicolaou, Thomas Penzel, Paul E. Peppard, Wendy S. Post, Alberto R. Ramos, Kenneth Rice, Jerome I. Rotter, Scott A. Sands, Neomi Shah, Chol Shin, Katie L. Stone, Beate Stubbe, Jae Hoon Sul, Mehdi Tafti, Kent D. Taylor, Alexander Teumer, Timothy A. Thornton, Gregory J. Tranah, Chaolong Wang, Heming Wang, Simon C. Warby, D.A. Wellman, Phyllis C. Zee, Craig L. Hanis, Cathy C. Laurie, Daniel J. Gottlieb, Sanjay R. Patel, Xiaofeng Zhu, Shamil Sunyaev, Richa Saxena, Xihong Lin, Susan Redline

Notice bibliographique

RevueAmerican Journal of Respiratory Cell and Molecular Biology · 2017
Typereview
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueObstructive Sleep Apnea Research
Établissements canadiensUniversité de Montréal
Organismes subventionnairesNational Center for Advancing Translational SciencesNational Center for Research ResourcesNational Institute of Arthritis and Musculoskeletal and Skin DiseasesNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesNational Heart, Lung, and Blood InstituteNational Institute on AgingNational Institute of Diabetes and Digestive and Kidney DiseasesUniversität GreifswaldChinese Society of Clinical OncologyFondation LeenaardsNational Cancer InstituteUniversity of TorontoBundesministerium für Bildung und ForschungGlaxoSmithKlineSchweizerischer Nationalfonds zur Förderung der Wissenschaftlichen ForschungU.S. Department of Health and Human ServicesNational Institutes of HealthNational Science Foundation
Mots-clésObstructive sleep apneaQuantitative trait locusNon-rapid eye movement sleepGenome-wide association studyLocus (genetics)Genetic associationGeneticsCandidate geneBiologyMedicineInternal medicineGenotypeGeneSingle-nucleotide polymorphismNeuroscienceEye movement

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Obstructive sleep apnea (OSA) is a common heritable disorder displaying marked sexual dimorphism in disease prevalence and progression. Previous genetic association studies have identified a few genetic loci associated with OSA and related quantitative traits, but they have only focused on single ethnic groups, and a large proportion of the heritability remains unexplained. The apnea–hypopnea index (AHI) is a commonly used quantitative measure characterizing OSA severity. Because OSA differs by sex, and the pathophysiology of obstructive events differ in rapid eye movement (REM) and non-REM (NREM) sleep, we hypothesized that additional genetic association signals would be identified by analyzing the NREM/REM-specific AHI and by conducting sex-specific analyses in multiethnic samples. We performed genome-wide association tests for up to 19,733 participants of African, Asian, European, and Hispanic/Latino American ancestry in 7 studies. We identified rs12936587 on chromosome 17 as a possible quantitative trait locus for NREM AHI in men (N = 6,737; P = 1.7 × 10−8) but not in women (P = 0.77). The association with NREM AHI was replicated in a physiological research study (N = 67; P = 0.047). This locus overlapping the RAI1 gene and encompassing genes PEMT1, SREBF1, and RASD1 was previously reported to be associated with coronary artery disease, lipid metabolism, and implicated in Potocki–Lupski syndrome and Smith-Magenis syndrome, which are characterized by abnormal sleep phenotypes. We also identified gene-by-sex interactions in suggestive association regions, suggesting that genetic variants for AHI appear to vary by sex, consistent with the clinical observations of strong sexual dimorphism.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Méta-analyse · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,774
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0080,004
Bibliométrie0,0020,001
Études des sciences et des technologies0,0000,002
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,077
Tête enseignante GPT0,407
Écart entre enseignants0,330 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeMéta-analyse
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations89
Publié2017
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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