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Enregistrement W2765890360 · doi:10.1186/s13072-017-0156-y

NuA4 histone acetyltransferase activity is required for H4 acetylation on a dosage-compensated monosomic chromosome that confers resistance to fungal toxins

2017· article· en· W2765890360 sur OpenAlexfundno aff
Hironao Wakabayashi, Christopher Tucker, Gabor Bethlendy, Anatoliy Kravets, Stephen Welle, Michael Bulger, Jeffrey J. Hayes, Elena Rustchenko

Notice bibliographique

RevueEpigenetics & Chromatin · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAntifungal resistance and susceptibility
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Institute of Diabetes and Digestive and Kidney DiseasesNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesNational Institutes of HealthUniversity of TorontoNational Institute of General Medical SciencesUniversity of Rochester
Mots-clésBiologyDosage compensationGeneticsHistone H4ChromosomeAcetylationGeneHistone acetyltransferasePloidyGene dosageAcetyltransferaseHistoneGene expression

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: The major human fungal pathogen Candida albicans possesses a diploid genome, but responds to growth in challenging environments by employing chromosome aneuploidy as an adaptation mechanism. For example, we have shown that C. albicans adapts to growth on the toxic sugar L-sorbose by transitioning to a state in which one chromosome (chromosome 5, Ch5) becomes monosomic. Moreover, analysis showed that while expression of many genes on the monosomic Ch5 is altered in accordance with the chromosome ploidy, expression of a large fraction of genes is increased to the normal diploid level, presumably compensating for gene dose. RESULTS: In order to understand the mechanism of the apparent dosage compensation, we now report genome-wide ChIP-microarray assays for a sorbose-resistant strain harboring a monosomic Ch5. These data show a significant chromosome-wide elevation in histone H4 acetylation on the mCh5, but not on any other chromosome. Importantly, strains lacking subunits of the NuA4 H4 histone acetyltransferase complex, orthologous to a complex previously shown in Drosophila to be associated with a similar gene dosage compensation mechanism, did not show an increase in H4 acetylation. Moreover, loss of NuA4 subunits severely compromised the adaptation to growth on sorbose. CONCLUSIONS: Our results are consistent with a model wherein chromosome-wide elevation of H4 acetylation mediated by the NuA4 complex plays a role in increasing gene expression in compensation for gene dose and adaption to growth in a toxic environment.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,343
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,057
Tête enseignante GPT0,351
Écart entre enseignants0,294 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations7
Publié2017
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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