Genetic Diversity of Isolates of Macrophomina phaseolina Associated with Cowpea from Brazil Semi-Arid Region
Notice bibliographique
Résumé
Cowpea crops have the highest social and economic relevance to Brazil, being the food base of families mainly in the semi-arid areas of the country. Charcoal rot caused by Macrophomina phaseolina is an economically important disease of cowpea that can cause significant reductions in bean yield. This study aimed to access the genetic diversity of M. phaseolina isolates obtained from cowpea grown in the Pernambuco semi-arid region, by molecular analysis. Fifty-one isolates, collected from municipality of Belém do São Francisco from cowpea plants and displaying typical symptoms and signs of charcoal rot, were studied using inter-simple sequence repeat (ISSR) markers. Unweighted pair-group method using arithmetic means (UPGMA) clustering of data showed that isolates clearly differentiate into two groups. The group 1 comprises the majority of isolates and the group 2 contains two isolates, isol46 and isol47. The highest similarity index (0.9) was observed between the isolates isol22 and isol35 and the lowest similarity index (0.2) was observed between isol37 and isol46 isolates. Our results revealed that the ISSR-PCR fingerprinting patterns were useful for differentiating M. phaseolina isolates from V. unguiculata plants sampled. Therefore, genetic characterization of this fungus is of importance for the effective disease management.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».