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Enregistrement W2766456060 · doi:10.12705/665.10

Species delimitation in the Caribbean <i>Gesneria viridiflora</i> complex (Gesneriaceae) reveals unsuspected endemism

2017· article· en· W2766456060 sur OpenAlexaff
François Lambert, John L. Clark, Simon Joly

Notice bibliographique

RevueTaxon · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePlant and Fungal Species Descriptions
Établissements canadiensEspace pour la vieUniversité de Montréal
Organismes subventionnairesEuropean Climate, Infrastructure and Environment Executive AgencyNational Geographic Society
Mots-clésSubspeciesEndemismGesneriaceaeSpecies complexTaxonomy (biology)BiodiversityBiologyBiodiversity hotspotEcologyTaxonGeographyCoalescent theoryHabitatMorphometricsPhylogenetic tree

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Accurate taxonomy and species boundaries are of great importance in biodiversity hotspots with high species endemicity like the Caribbean. Indeed, inaccurate species delimitations can affect biodiversity estimates and influence the decisions taken on conservation issues. The genera Gesneria and Rhytidophyllum constitute the main representatives of the Caribbean Gesneriaceae and contain a few complexes with unclear taxonomic boundaries that are characterized by a confusing history of taxonomic changes and by the presence of several recognized varieties and subspecies. Gesneria viridiflora is a good example of such a complex. Four geographically isolated subspecies are recognized that have similar but variable vegetative and reproductive characters, and numerous taxonomic changes have been suggested in this group over the years. In this study, we used multivariate approaches to delimit distinct clusters of individuals using morphological (qualitative and quantitative characters) and molecular data from four nuclear markers. These groups are then tested using a Bayesian coalescent species delimitation approach and compared using multivariate analyses of bioclimatic variables obtained from occurrence data. The results suggest the presence of four distinct species in this complex according to the unified species concept: G . quisqueyana , G . sintenisii , G . sylvicola and G . viridiflora . We also maintain G. viridiflora subsp. acrochordonanthe that does not fulfill our criteria for a species but that shows morphological variation associated to a specific geographical area. A distribution map, an identification key to the species, and a taxonomic treatment are provided. The new taxonomy proposed in this study shows an unsuspected species endemism in some regions of the Caribbean and underlines the importance of investigating species delimitation in diversified groups containing taxonomically complex taxa with poorly defined boundaries.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,008
Score d'incertitude au seuil0,016

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0020,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,059
Tête enseignante GPT0,273
Écart entre enseignants0,213 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations9
Publié2017
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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