Plant-growth-promoting rhizobacteria <i>Bacillus</i> <i>subtilis</i> RR4 isolated from rice rhizosphere induces malic acid biosynthesis in rice roots
Notice bibliographique
Résumé
Malic acid (MA), one of the major organic acid exudates from roots, plays a significant role in the chemotaxis of beneficial bacteria to the plant's rhizosphere. In this study, the effect of a plant-growth-promoting rhizobacterium, Bacillus subtilis RR4, on the synthesis and exudation of MA from roots is demonstrated in rice. To test the chemotactic ability of strain RR4 towards MA, a capillary chemotaxis assay was performed, which revealed a positive response (relative chemotactic ratio of 6.15 with 10 μmol/L MA); with increasing concentrations of MA, an elevated chemotactic response was observed. Quantitative polymerase chain reaction, performed to analyze the influence of RR4 on the MA biosynthetic gene, malate synthase (OsMS), and the transporter gene, aluminium-activated malate transporter (OsALMT), demonstrated significant differential expression, with 1.8- and -0.58-fold changes, respectively, in RR4-treated roots. The gene expression pattern of OsMS corroborated the data obtained by high-performance liquid chromatography, which showed elevated MA levels in roots (1.52-fold), whereas the levels of MA in root exudates were not altered significantly although expression of OsALMT was reduced. Our results demonstrate that B. subtilis RR4 is chemotactic to MA and can induce biosynthesis of MA in rice roots.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».