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Enregistrement W2767052129 · doi:10.1111/cge.13158

Molecular analysis and genotype‐phenotype correlation of Diamond‐Blackfan anemia

2017· article· en· W2767052129 sur OpenAlexafffundabout
Omri Avraham Arbiv, Geoff D.E. Cuvelier, Robert J. Klaassen, Conrad V. Fernandez, Nancy Robitaille, MacGregor Steele, Vicky R. Breakey, Sharon Abish, John K. Wu, Rajesh Kumar Sinha, Marinalda Boneli da Silva, Lisa Goodyear, Lawrence Jardine, JH Lipton, Catharine Corriveau-Bourque, Josée Brossard, Bruno Michon, Ibrahim Ghemlas, Nicolas Waespe, Bozana Zlateska, Lillian Sung, Michaela Cada, Yigal Dror

Notice bibliographique

RevueClinical Genetics · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueRNA modifications and cancer
Établissements canadiensUniversity of TorontoInstitute for Clinical Evaluative SciencesHealth and Social Services Centre University Institute of Geriatrics of SherbrookeBC Children's HospitalCentre hospitalier de l'Université LavalCentre Hospitalier Universitaire de SherbrookeMcMaster Children's HospitalAlberta HealthJaneway Children's Health and Rehabilitation CentreUniversity of AlbertaSickKids FoundationAlberta Health ServicesPrincess Margaret Cancer CentreHospital for Sick ChildrenUniversity of SaskatchewanIzaak Walton Killam Health CentreAlberta Children's HospitalQueen's UniversityCentre Hospitalier Universitaire Sainte-JustineChildren's Hospital of Western OntarioCancerCare ManitobaChildren's Hospital of Eastern OntarioHealth Sciences CentreMontreal Children's Hospital
Organismes subventionnairesC17 CouncilCanadian Institutes of Health ResearchAmerican Society of Hematology
Mots-clésDiamond–Blackfan anemiaPhenotypeGenotypeGeneticsCorrelationGenotype-phenotype distinctionBiologyGeneRNA

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Diamond-Blackfan anemia (DBA) features hypoplastic anemia and congenital malformations, largely caused by mutations in various ribosomal proteins. The aim of this study was to characterize the spectrum of genetic lesions causing DBA and identify genotypes that correlate with phenotypes of clinical significance. Seventy-four patients with DBA from across Canada were included. Nucleotide-level mutations or large deletions were identified in 10 ribosomal genes in 45 cases. The RPS19 mutation group was associated with higher requirement for chronic treatment for anemia than other DBA groups. Patients with RPS19 mutations, however, were more likely to maintain long-term corticosteroid response without requirement for further chronic transfusions. Conversely, patients with RPL11 mutations were less likely to need chronic treatment. Birth defects, including cardiac, skeletal, hand, cleft lip or palate and genitourinary malformations, also varied among the various genetic groups. Patients with RPS19 mutations had the fewest number of defects, while patients with RPL5 had the greatest number of birth defects. This is the first study to show differences between DBA genetic groups with regards to treatment. Previously unreported differences in the rate and types of birth defects were also identified. These data allow better patient counseling, a more personalized monitoring plan, and may also suggest differential functions of DBA genes on ribosome and extra-ribosomal functions.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,180
Score d'incertitude au seuil0,371

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,027
Tête enseignante GPT0,348
Écart entre enseignants0,321 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations36
Publié2017
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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