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Enregistrement W2767525887 · doi:10.1093/neuonc/nox168.943

STEM-28. DOT1L EPIGENETICALLY REGULATES GBM BRAIN TUMOR STEM CELLS

2017· article· en· W2767525887 sur OpenAlexaff
Danielle Bozek, Alice Wang, Xiaoguang Hao, Michael E. Johnston, H. Artee Luchman, Samuel Weiss

Notice bibliographique

RevueNeuro-Oncology · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueEpigenetics and DNA Methylation
Établissements canadiensUniversity of CalgaryHotchkiss Brain InstituteOntario Brain Institute
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyCancer researchEpigeneticsStem cellCarcinogenesisDNA methylationGene silencingHistoneCancer stem cellCancerCell biologyGeneticsGene expressionGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The median survival for patients diagnosed with Glioblastoma (GBM) is only 14 months, due to recurrence, despite current treatment options of surgery, radio- and chemo- therapies. Recurrence results from the invasion of GBM cancer cells away from the initial cancerous mass and may be due to brain tumor stem cells (BTSCs) that are resistant to therapy and capable of tumor initiation. Recently, epigenetic-based therapies have become of great interest given that, unlike genomic mutations, epigenetic alterations are potentially reversible. Disrupter of telomeric silencing-1-like (DOT1L) is the only known histone methyltransferase responsible for histone-3-lysine-79 methylation (H3K79me), an epigenetic mark associated with active gene transcription. Previous studies investigating the therapeutic implications of targeting DOT1L in cancer have shown that its inhibition in leukemia results in cancer cell death and, in solid cancers, decreases metastasis. We investigated the role of DOT1L in GBM BTSCs. Long term treatment with the DOT1L inhibitor EPZ-5676 decreased H3K79me2 levels in BTSCs and altered BTSC sphere morphology, sphere initiating frequency, proliferation, migration and invasion. To investigate the mechanism by which DOT1L may regulate GBM tumorigenesis and growth we performed qPCR, flow cytometry, RNA-sequencing and H3K79me2 ChIP-sequencing of BTSC lines, following treatment with EPZ-5676. We found that DOT1L inhibition decreases the expression of GBM stem and progenitor cell genes and increases the expression of genes associated with neuronal and astrocytic differentiation. Furthermore, H3K79me2 ChIP sequencing revealed that DOT1L histone methylation was reduced within the gene body of stem and progenitor cell genes. Flank xenograft studies, of mice treated with EPZ-5676, revealed that DOT1L inhibition promotes neuronal and astrocytic differentiation in tumors. Ongoing pre-clinical studies are assessing the effect of DOT1L inhibition on survival in an orthotopic xenograft model of GBM and investigating rational combinatorial targeting strategies, with a long-term aim of preventing GBM recurrence and improving overall patient survival.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,008

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,020
Tête enseignante GPT0,287
Écart entre enseignants0,268 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2017
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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