8th IAS Conference on HIV Pathogenesis, Treatment & Prevention 19-22 July 2015, Vancouver, Canada
Notice bibliographique
Résumé
Introduction Sensitive assays are needed for detection of residual HIV in patients with undetectable plasma viral loads to determine if eradication strategies are effective. The gold standard quantitative viral outgrowth assay (QVOA) underestimates the magnitude of the viral reservoir, while sensitive PCR-based assays lack the ability to distinguish replication competent from defective virus. We sought to determine whether xenograft of leukocytes from HIV-1 infected patients with undetectable plasma viral loads into severely immunocompromised mice would result in viral amplification and measurable viral loads within the aberrant murine host. Methods We evaluated whether xenograft of 1) peripheral blood mononuclear cells (PBMCs) from five HIV-1+ patients on suppressive antiretroviral therapy (ART), 2) PBMCs or purified resting CD4+ T cells from 5 HIV-1+ elite suppressors (ES), or 3) PBMCs from a Simian Immunodeficiency Virus (SIV)+ pigtailed macaque on suppressive ART, all with undetectable plasma viral loads, into NOD. Cg-PrkdcscidIl2rgtm1Wjl/SzJ (NSG) mice resulted in viral amplification in the mouse. Successful xenograft of mice was confirmed by flow cytometry. Human CD8+ T cells were depleted in humanized mice with depleting antibody, and CD4+ T cells were activated in a subset of mice with activating anti-CD3. Plasma viral loads in xenografted mice were quantified using qRT-PCR, and compared to plasma viral load and QVOA results from the human or macaque donor. Results With this murine viral outgrowth assay (MVOA), we amplified HIV-1 from all 10 HIV+ subjects with undetectable plasma viral load, including an ES from whom we were unable to recover virus by QVOA. We detected HIV in mice an average of 20 days after xenograft with PBMCs from patients on suppressive ART, and an average of 28 days after xenograft with PBMCs or resting CD4+ T cells from ES. For two of the mice xenografted with CD4+ T cells from ES, we detected HIV only after activation with anti-CD3. We similarly detected SIV in macaquized mice by seven days post-xenograft. Conclusions The MVOA has the potential to serve as a powerful tool to identify residual HIV-1 in patients with undetectable viral loads, such as those who have undergone promising cure therapies. Abstract MOAA0101–Figure 1. MVOA for detection of residual virus. 10.7448/IAS.18.5.20320 © 2015 Pate K M et al; licensee International AIDS Society Published 22 July 2015 Presenting author email: [email protected]
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,003 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,002 |
| Études des sciences et des technologies | 0,003 | 0,001 |
| Communication savante | 0,005 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,002 | 0,003 |
| Intégrité de la recherche | 0,003 | 0,003 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,178 | 0,087 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».