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Enregistrement W2769387217 · doi:10.1523/jneurosci.0936-17.2017

Abnormal Microglia and Enhanced Inflammation-Related Gene Transcription in Mice with Conditional Deletion of<i>Ctcf</i>in<i>Camk2a-Cre</i>-Expressing Neurons

2017· article· en· W2769387217 sur OpenAlexfundno aff
Bryan E. McGill, Ruteja A. Barve, Susan E. Maloney, Amy Strickland, Nicholas Rensing, Peter L. Wang, Michael Wong, Richard D. Head, David F. Wozniak, Jeffrey Milbrandt

Notice bibliographique

RevueJournal of Neuroscience · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueNeuroinflammation and Neurodegeneration Mechanisms
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesEunice Kennedy Shriver National Institute of Child Health and Human DevelopmentNational Center for Advancing Translational SciencesNational Cancer InstituteIntellectual and Developmental Disabilities Research Center, Washington University School of Medicine in St. LouisAlvin J. Siteman Cancer CenterNational Institutes of HealthNational Center for Research ResourcesNational Institute of Neurological Disorders and StrokeInstitute of Clinical and Translational SciencesIntellectual and Developmental Disabilities Research CenterNational Institute on AgingHope Center for Neurological DisordersNational Heart, Lung, and Blood InstituteMcGill University
Mots-clésCTCFBiologyMicrogliaChromatinForebrainTranscription factorCell biologyNeuroscienceGeneticsGeneInflammationImmunologyCentral nervous systemEnhancer

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

CCCTC-binding factor (CTCF) is an 11 zinc finger DNA-binding domain protein that regulates gene expression by modifying 3D chromatin structure. Human mutations inCTCFcause intellectual disability and autistic features. Knocking outCtcfin mouse embryonic neurons is lethal by neonatal age, but the effects of CTCF deficiency in postnatal neurons are less well studied. We knocked outCtcfpostnatally in glutamatergic forebrain neurons under the control ofCamk2a-Cre. CtcfloxP/loxP;Camk2a-Cre+(CtcfCKO) mice of both sexes were viable and exhibited profound deficits in spatial learning/memory, impaired motor coordination, and decreased sociability by 4 months of age.CtcfCKO mice also had reduced dendritic spine density in the hippocampus and cerebral cortex. Microarray analysis of mRNA fromCtcfCKO mouse hippocampus identified increased transcription of inflammation-related genes linked to microglia. Separate microarray analysis of mRNA isolated specifically fromCtcfCKO mouse hippocampal neurons by ribosomal affinity purification identified upregulation of chemokine signaling genes, suggesting crosstalk between neurons and microglia inCtcfCKO hippocampus. Finally, we found that microglia inCtcfCKO mouse hippocampus had abnormal morphology by Sholl analysis and increased immunostaining for CD68, a marker of microglial activation. Our findings confirm thatCtcfKO in postnatal neurons causes a neurobehavioral phenotype in mice and provide novel evidence that CTCF depletion leads to overexpression of inflammation-related genes and microglial dysfunction. SIGNIFICANCE STATEMENTCCCTC-binding factor (CTCF) is a DNA-binding protein that organizes nuclear chromatin topology. Mutations inCTCFcause intellectual disability and autistic features in humans. CTCF deficiency in embryonic neurons is lethal in mice, but mice with postnatal CTCF depletion are less well studied. We find that mice lackingCtcfinCamk2a-expressing neurons (CtcfCKO mice) have spatial learning/memory deficits, impaired fine motor skills, subtly altered social interactions, and decreased dendritic spine density. We demonstrate thatCtcfCKO mice overexpress inflammation-related genes in the brain and have microglia with abnormal morphology that label positive for CD68, a marker of microglial activation. Our findings suggest that inflammation and dysfunctional neuron–microglia interactions are factors in the pathology of CTCF deficiency.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,009

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,023
Tête enseignante GPT0,259
Écart entre enseignants0,236 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations81
Publié2017
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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